急性心肌梗死发病过程中miR-30a-5p的变化及其潜在的分子机制

梁国新, 郭畅, 唐红悦, 张明明

西安交通大学学报(医学版) ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (4) : 567 -574.

西安交通大学学报(医学版) ›› 2024, Vol. 45 ›› Issue (4) : 567 -574.

急性心肌梗死发病过程中miR-30a-5p的变化及其潜在的分子机制

    梁国新, 郭畅, 唐红悦, 张明明
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摘要

目的 评估miR-30a-5p作为急性心肌梗死(acute myocardial infarction, AMI)新诊断指标的潜力和潜在的分子机制。方法 下载GEO数据库中AMI相关microRNAs(miRNAs)和mRNA芯片数据集。qRT-PCR技术检测血清样本中miRNAs的水平,全自动生化仪检测其他的生化指标。受试者工作特征(ROC)曲线分析和Spearman相关性分析评估miR-30a-5p作为诊断AMI标志物的价值。R语言multiMiR包对miR-30a-5p的靶基因进行预测,STRING数据库构建蛋白相互作用网络,将结果导入Cytoscape3.7.1软件,筛选网络的中枢基因。R语言clusterProfiler包对中枢基因进行KEGG及GO分析,探索miR-30a-5p在AMI中的临床意义及其潜在的分子机制。结果 与对照组比较,AMI组患者血清中的miR-30a-5p上调,差异有统计学意义(P<0.05);miR-30a-5p与CK-MB、CK、TnT、proBNP和CRP水平呈正相关(rs=0.489,P<0.001;rs=0.347,P<0.001;rs=0.545,P<0.001;rs=0.533,P<0.001;rs=0.206,P<0.05),ROC曲线下面积(AUC)为0.862,灵敏度为84.4%,特异度为74.2%;2个数据集共得到差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)780个,miR-30a-5p的靶基因共1 061个,取交集共鉴定出61个共同基因。在PPI的中枢基因中BCL6、FOSL2、JDP2、LYN、PDE4D、SOCS3和SOX4得分较高且与AMI的发生密切相关;KEGG和GO富集分析显示,miR-30a-5p可能调节JAK-STAT、NF-kappaB及Wnt等信号通路参与炎症反应、细胞凋亡、自噬及心肌梗死后重塑等过程进而参与AMI的发生。结论 血清miR-30a-5p在AMI早期表达上调,对miR-30a-5p及其调控通路的研究,有助于诊断及治疗AMI。

关键词

基因表达数据库(GEO) / 急性心肌梗死(AMI) / microRNAs(miRNAs) / 生物信息学

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梁国新, 郭畅, 唐红悦, 张明明. 急性心肌梗死发病过程中miR-30a-5p的变化及其潜在的分子机制[J]. 西安交通大学学报(医学版), 2024, 45(4): 567-574 DOI:

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