一株柯萨奇病毒A组4型云南株的全基因组分析

摘要

目的 了解中国云南2022年分离到的一株柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4, CVA4)病毒株的全基因组序列特征，探讨CVA4系统发育特征。方法 对CVA4分离株194R3/YN/CHN/2022进行全基因组序列扩增测序，并应用Mega 7.0、Geneious 9.1.4及Simplot 3.5.1等软件拼接比对，构建CVA4分离株系统进化树，分析其全基因组序列特征。结果 194R3/YN/CHN/2022分离株为CVA4,属于C2基因亚型，与我国近年的优势基因亚型一致。重组分析显示，在P2、P3非结构编码区，CVA4病毒分离株可能与EVA114原型株V13-0285、CVA16原型株G-10、CVA14原型株G-14发生过重组。结论 云南分离的194R3/YN/CHN/2022属于CVA4中国流行的C2基因亚型，但发生了一定变异。

关键词

柯萨奇病毒A组4型 / 全基因组序列 / 系统进化分析 / 194R3/YN/CHN/2022