江苏省2016—2021年临床分离铜绿假单胞菌耐药及基因组特征分析

摘要

目的 了解江苏地区临床分离的铜绿假单胞菌耐药情况及基因特征。方法 收集2016—2021年江苏地区各哨点医院临床分离的铜绿假单胞菌，采用肉汤稀释法对分离株进行10类19种抗菌药物的敏感性测定，对分离株行全基因组测序并多位点序列分型，综合抗菌药物耐药性数据库(CARD)扫描分析耐药基因。结果 2016—2021年通过致病菌识别网12个市的哨点医院收集患者分离的铜绿假单胞菌101株。药敏试验结果显示，全部菌株对共计6类8种抗菌药物全部耐药，包括酰胺醇类抗生素氯霉素、磺胺类的复方磺胺甲口恶唑、头孢菌素类的头孢噻肟和头孢唑林、四环素类的四环素、青霉素类的氨苄西林及氨苄西林/舒巴坦以及β-内酰胺类的阿莫西林/克拉维酸；45.54%的分离株为碳青霉烯类耐药菌株，对亚胺培南、美罗培南两种碳青霉烯类抗生素的耐药率已分别达45.54%、39.60%;耐10种以上抗生素的菌株达63.36%;共发现35种耐药表型，其中1株菌对19种抗菌药物广泛耐药，耐药谱为AMC-AM-SAM-CZ-CTX-C-TE-SXT的菌株最多(31.69%,32株)。多位点序列分析发现75个ST型，聚类发现ST 262处于中心点，并遗传进化出11个亚型或分支。全基因组扫描发现6类18种抗菌药物耐药基因，crpP基因的携带情况与表型完全一致。结论 2016—2021年江苏地区临床分离的铜绿假单胞菌耐药情况严重，两种碳青霉烯类抗生素的耐药率、耐10种以上抗生素的菌株比例高于国内其他省份，应引起高度重视。

关键词

铜绿假单胞菌 / 耐药性 / 全基因组测序 / 耐药基因 / 多位点序列分型