基于全基因组测序的ICU环境中肺炎克雷伯菌耐药及分子特征分析

摘要

目的 了解医疗机构综合重症监护病房（ICU）环境中肺炎克雷伯菌（KP）、高毒力肺炎克雷伯菌（hvKP）、耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（CRKP）及高毒耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌（hv-CRKP/CR-hvKP）的分布特征，为ICU环境评估与医院感染防控提供参考。方法 2019、2023年共采集上海市医疗机构综合ICU 3 336份环境标本，分离菌株后进行药敏试验和全基因组测序。结果 KP检出率为1.59%（53株）,其中hvKP、CRKP、hv-CRKP/CR-hvKP分别占总检出数的37.74%（20/53）、52.83%（28/53）、24.53%（13/53）。hvKP主要为ST11-KL64、ST11-KL25,CRKP主要为ST15-KL19、ST11-KL25,hv-CRKP/CR-hvKP主要为ST11-KL25、ST11-KL64。主要携带的耐药基因有fosA、oqxAB、tet（A）、bla_TEM-1B、bla_KPC-2、qnrS11等。所有菌株均携带毒力基因fimH、iutA、entA、entB、entC、entD、entE、entF,仅1株检出rmpA基因。结论 医疗机构综合ICU环境中KP污染广泛，以ST11和ST15为优势，呈多态性分布。CRKP和hvKP占比较高，且多重耐药情况严峻。KP存在耐药与毒力共进化的情形，提示综合ICU环境污染对患者具有感染和致病危害，临床需加强重视并警惕暴发风险。

关键词

ICU环境 / 肺炎克雷伯菌 / 全基因组测序 / 耐药表型 / 基因型