基于全基因组测序的腹泻患者沙门菌血清型、耐药性及毒力基因特征分析

摘要

目的 分析腹泻患者来源沙门菌的血清型分布、耐药情况、分子分型及毒力因子携带特征。方法 收集2021—2024年某地区临床腹泻患者粪便标本分离培养的沙门菌。采用血清玻片凝集法鉴定血清型，微量肉汤稀释法进行抗菌药物敏感性试验；采用全基因组测序技术分析核心基因组多位点序列分型（cgMLST）、耐药基因及毒力基因携带情况，探究沙门菌ST、耐药特征与毒力特征分布情况。结果 共检出30株非重复沙门菌，分属13个血清型和12个ST型，优势血清型为肠炎沙门菌（ST11）和鼠伤寒沙门菌（ST19）。药敏试验结果显示，检出的沙门菌对链霉素耐药率最高[80.00%（24株）]，其次为氨苄西林（66.67%）、萘啶酸（56.67%）和四环素（53.33%）。共检出多重耐药菌20株（66.67%），其中11株（36.67%）对5类及以上抗菌药物耐药，1株鼠伤寒沙门菌变种与1株汤卜逊沙门菌对9类受试抗菌药物均表现为耐药。耐药基因检测显示，携带率较高的基因为aac（6′）-Iaa、sul2、bla_TEM-1B、aph（3″）-Ib及aph（6）-Id。毒力基因分析显示，所有分离株均携带分泌系统相关因子、非菌毛黏附相关因子、镁离子转运相关因子及菌毛黏附相关因子等4类毒力因子。结论 该地区腹泻患者来源的沙门菌血清型呈现多样性，多重耐药现象严重，且菌株普遍携带多种毒力因子。应持续加强本地区沙门菌的耐药性及毒力因子主动监测，为临床抗感染治疗及公共卫生防控策略的制定提供科学依据。

关键词

沙门菌属 / 血清型 / 全基因组测序 / 抗菌药物耐药 / 毒力因子

基金资助

国家自然科学基金项目（32202158）; 淮安市基础研究计划重点项目（HAB202048、HAB2025076）