医院环境中肺炎克雷伯菌分子特征及高风险抗菌药物耐药基因识别

摘要

目的 分析医院环境来源肺炎克雷伯菌（KP）的高风险分子特征,识别具有潜在传播风险的高风险耐药基因及其相关遗传结构。方法 收集2023—2025年上海市2所医院环境来源KP 20株和临床来源KP 112株,进行全基因组测序、多位点序列分型（MLST）、系统发育及耐药、毒力基因分析,并结合可移动遗传元件（MGEs）关联证据筛选高风险抗菌药物耐药基因（ARGs）,分析其局部遗传结构。结果132株KP共分为18种序列分型（ST）,ST11为优势型别,占53.79%（71株）。医院环境菌株未形成独立系统发育分支,而是散在分布于以临床菌株为主的分支中。医院环境菌株中高毒力相关核心基因阳性率为40.00%,耐药与高毒力相关特征共存比率为25.00%。识别出bla_KPC、bla_CTX-M、rmt B和bla_NDM 4类核心高风险ARGs;其与MGEs存在不同程度关联,其中bla_KPC和rmtB在部分环境菌株中呈现相对重复的局部结构模式。结论 医院环境来源KP呈现一定高风险分子特征,部分高风险ARGs与MGEs存在关联,提示相关耐药基因可能具有潜在水平转移及进一步播散风险。

关键词

肺炎克雷伯菌 / 医院环境 / 分子流行特征 / 高风险耐药基因 / 可移动遗传元件

基金资助

上海市公共卫生研究专项（2024GKQ15）