食管鳞癌患者和健康人口腔菌群的比较和意义

摘要

目的 基于中国食管癌高发区人群，通过比较食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)患者和健康对照者口腔菌群分布特征和构成差异，鉴定ESCC相关的特异性口腔菌群标志物，为筛选早期诊断和早期筛查ESCC的菌群标志物奠定基础。方法 收集安阳市肿瘤医院经病理学确诊的48例原发性ESCC患者和50例经性别、年龄匹配的健康对照的口腔拭子样本，进行V3～V4区域16S rRNA基因测序，采用Wilcoxon秩和检验比较两组菌群Alpha多样性及相对丰度差异，采用线性判别分析(linear discriminant analysis effect size, LEfSe)筛选差异性物种，ROC曲线分析菌群预测ESCC的价值。结果 ESCC患者菌群多样性低于健康对照组(P<0.05),且两组人群的菌群整体构成不同(P=0.001)。厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门是两组常见门类。相比于健康对照组，ESCC组厚壁菌门和梭杆菌门相对丰度升高，而变形菌门和放线菌门丰度减少(均P<0.05);ESCC组链球菌属、梭杆菌属、拟普雷沃氏菌属和纤毛菌属等属的丰度显著提升，而奈瑟菌属、二氧化碳噬纤维菌属等属的丰度下降(均P<0.05)。特别重要的是，牙龈卟啉单胞菌、牙髓卟啉单胞菌、坦纳拟普雷沃菌、南锡普雷沃菌等菌种在ESCC组富集；联合南锡普雷沃菌、坦纳拟普雷沃菌和牙龈卟啉单胞菌区分ESCC与健康个体(AUC=0.728,特异度0.760,灵敏度0.646)的效果优于任一单个菌种。结论 牙龈卟啉单胞菌、坦纳拟普雷沃菌、南锡普雷沃菌和牙髓卟啉单胞菌是初步筛查ESCC患者的菌群标志物，且联合前三个菌种有区分ESCC与健康个体的良好效能。

关键词

食管鳞状细胞癌 / 口腔菌群 / 16S rRNA基因测序