tNGS在儿童肺炎支原体肺炎诊治中的应用

摘要

目的 探讨病原靶向二代测序技术(targeted next-generation sequencing test, tNGS)检测病原体及耐药基因在儿童肺炎支原体肺炎诊治中的应用。方法 分析2022年7月至2023年12月在华中科技大学同济医学院附属同济医院住院确诊为肺炎支原体肺炎患儿的临床资料，比较不同性别、年龄、病程、临床特征患儿之间通过tNGS检出肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)病原序列数的差异；以是否难治作为标准，验证tNGS检测大环内酯类耐药基因的性能；利用ROC曲线探索MP耐药基因检测的最佳预测界值。结果 共纳入497例病例，其中男性257例(51.7%),女性240例(48.3%),年龄分布为3月～13岁[平均年龄(6.08±2.68)岁],平均发热病程为(6.04±3.42)d,平均咳嗽病程为(7.46±5.54)d。所有患儿用tNGS方法均检测出MP序列，不同性别或年龄患儿检出的MP序列数无明显差异，病程在1周以内的患儿MP序列数显著高于病程超过1周的患儿，MP核酸阳性患儿MP序列数显著高于核酸阴性患儿。下呼吸道标本检出的MP序列数显著高于上呼吸道标本，重症患儿检出的MP序列数显著高于非重症患儿，而是否存在肺内并发症及是否难治的患儿之间检出的MP序列数无明显差异。tNGS检测MP耐药基因的总体诊断灵敏度为92.8%,特异度为27.8%,阳性预测值48.3%,阴性预测值84.2%,突变位点均为23S rRNA:A2063G。MP病原序列数与耐药基因序列数的比值为6.83是预测是否耐药的最佳界值，比值>6.83时，具有更大的阴性预测价值。结论 tNGS具有肺炎支原体肺炎的早期诊断价值，检出的MP序列数在预测病情轻重方面可能具有指导意义，耐药基因检测的阴性预测价值更高。

关键词

肺炎支原体 / tNGS / 耐药基因