二代测序技术检测胃癌患者基因突变及其临床病理特征分析

摘要

目的 分析中国胃癌患者的基因突变特征,探讨其与临床病理特征及预后的相关性。方法 纳入55例胃癌患者,采用二代测序(next-generation sequencing,NGS)检测肿瘤相关基因突变、微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)和肿瘤突变负荷(tumor mutational burden,TMB)。分析高频突变基因与临床病理特征及无进展生存期(progression-free survival,PFS)的关系,并利用TCGA-STAD队列(n=436)验证关键发现及分析种族异质性。结果 85.45%(47/55)的患者检出突变,高频体系突变基因包括TP53(29.09%)、ARID 1A(16 36%)、CDH1(14.55%)、LRP1B(14.55%)和PIK3CA(12.73%)。TP53突变与T4分期(P=0.028)和弥漫型胃癌(P=0.008)相关;CDH1突变与印戒细胞癌(P=0.012)和低分化肿瘤相关(P=0.006)。20%(11/55)的患者携带致病性胚系突变。单变量生存分析显示,CDH1突变是PFS的独立不良预后因素[风险比(hazard ratio,HR)=3.110,95%置信区间(confidence interval,CI):3.370～20.000]。TCGA队列验证证实,CDH1突变的不良预后效应仅存在于亚洲人群(HR=5.00,95%CI:2.01～12.43),表明存在种族的异质性。结论 中国胃癌患者具有独特的基因突变谱,关键基因突变与肿瘤侵袭性密切相关。本研究通过多队列验证提示CDH1等基因的预后价值可能存在种族差异,强调在中国人群中进行精准分子分型的必要性。

关键词

胃癌 / 二代测序 / 基因突变 / 预后 / 精准医疗