肺腺癌中双硫死亡通路相关基因的鉴定及预后模型的建立

摘要

目的 建立肺腺癌(LUAD)与双硫死亡(DS)通路相关的基因(DPRGs)预后模型，阐明其潜在的生物学机制。方法 LUAD相关基因测序及临床信息源于公共数据库。使用基因集变异分析(GSVA)结果与癌症基因组图谱(TCGA)数据集中mRNA表达量的相关性筛选DS通路中显著活跃的基因。基于最小绝对收缩和选择算子(LASSO)分析和随机森林(RF)算法筛选出DPRGs,使用多因素Cox回归分析构建风险评分(RS)模型，并通过基因表达综合数据库(GEO)进行验证。根据RS中位数将样本分为高、低风险组并进行分析。建立7个DPRGs的蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络，发现与其他蛋白互作关系最多的蛋白是乳酸脱氢酶A (LDHA),并进一步研究其功能及表达情况。结果 本研究筛选共得到7个DPRGs:SLC2A1、LDHA、SNAI2、ACO2、FGF12、ANP32B和ST13,由以上基因构建的预后模型验证效能较高。Kaplan-Meier生存分析结果显示，4个数据集中，高风险组LUAD患者的总生存时间与低风险组比较，差异有统计学意义(P<0.05)。高、低风险组差异表达基因富集分析发现，差异基因于p53信号通路、细胞周期等通路富集。实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)及免疫组织化学法结果表明，与正常组织相比，LUAD组织中LDHA表达水平升高。结论 基于DPRGs建立的预测模型能有效预测患者预后，可能为LUAD患者的治疗和预后提供思路。

关键词

双硫死亡通路 / 基因集变异分析 / 预后模型 / 肺腺癌 / 生物学过程 / 乳酸脱氢酶A