基于N6-甲基腺苷修饰与免疫细胞浸润的结直肠癌预后模型构建及验证

摘要

目的 探讨N6-甲基腺苷（m⁶A）修饰相关基因和免疫细胞浸润在结直肠癌（CRC）中的预后价值并构建相应风险模型预测患者临床结局。方法 从癌症基因组图谱（TCGA）和基因表达综合数据库（GEO）下载CRC患者的肿瘤组织转录组数据及匹配临床信息，通过共识聚类及单样本基因组富集分析明确m⁶A修饰相关基因及免疫细胞浸润在CRC中的预后价值。基于加权基因共表达网络分析（WGCNA）筛选与两者相关的预后基因，运用Lasso回归分析构建多基因风险模型，并在基因表达谱交互分析（GEPIA）数据库中对筛选出的预后基因进行表达差异分析。通过Kaplan-Meier生存分析明确风险模型在不同亚组及外部验证队列中的预测效能。结果 基于21个m⁶A修饰相关基因及24个免疫细胞浸润的特征表型均可以显著区分TCGA队列中CRC患者预后。CRC组织中多数m⁶A修饰相关基因与免疫细胞浸润显著相关。WGCNA及Lasso回归分析筛选出4个预后基因，分别为内凝集蛋白1、淋巴细胞抗原6复合位点G6D、无调性同族体1和基质金属蛋白酶28。在结直肠癌组织中，淋巴细胞抗原6复合位点G6D和基质金属蛋白酶28的表达与癌旁组织比较，差异有统计学意义（P<0.05）。基于上述预后基因构建的风险模型能够在TCGA队列的不同临床亚组及GEO验证队列中有效识别预后不良的潜在风险人群。结论 基于m⁶A修饰及免疫细胞浸润构建风险模型能够有效预测CRC患者的临床结局，相关预后基因有望成为抗CRC的潜在分子靶点。

关键词

结直肠癌 / N6-甲基腺苷修饰相关基因 / 免疫细胞浸润 / 生物标志物 / 预后

基金资助

国家自然科学基金项目(81902422); 江苏省基础研究计划自然科学基金面上项目(BK20231245); 江苏省卫生健康委面上项目(M2020024); 江苏省科协青年科技人才托举工程(TJ-2022-022); 扬州大学医学创新转化专项基金临床转化研究项目(AHYZUZHXM 202104); 江苏省研究生科研创新计划项目(KYCX23＿3621); 江苏省研究生实践创新计划项目(SJCX23＿2027,SJCX21-1646)