胃癌中免疫相关基因SLC7A7的鉴定与初步验证

摘要

目的 通过生物信息学方法筛选胃癌新型免疫相关基因，并在胃癌细胞中进行初步实验验证，以及通过多组学整合揭示SLC7A7在胃癌免疫微环境中的作用。方法 从GEO数据库获取胃癌数据集，分析得到差异表达基因。采用STRING软件分析蛋白互作关系，借助Metascape进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结合TCGA数据，验证基因表达与临床特征的相关性。采用TIMER2.0分析SLC7A7在泛癌中的表达情况。采用Kaplan-Meier Plotter进行生存分析。通过逆转录定量聚合酶链式反应（RT-qPCR）验证SLC7A7在胃癌细胞系中的表达水平。结果 SLC7A7在胃癌及多种癌症中高表达，且与不良预后有关。SLC7A7可能通过PI3K-Akt和AMPK信号通路发挥作用。SLC7A7与记忆B细胞、初始B细胞、单核细胞及活化NK细胞呈负相关，与活化CD4⁺记忆T细胞、γδT细胞、静止NK细胞、未极化巨噬细胞以及M1/M2型巨噬细胞呈正相关。RT-qPCR结果表明，SLC7A7在5种胃癌细胞系（HGC-27、NCI-N87、MKN-45、MKN-74和AGS）中高表达。结论 SLC7A7在胃癌细胞系中高表达，且与胃癌患者肿瘤细胞免疫浸润及不良预后相关。

关键词

胃癌 / 差异表达基因 / 溶质载体家族7成员7 / 生物信息学 / 免疫浸润 / 肿瘤微环境 / 预后标志物 / 信号通路