Anoikis和肿瘤免疫微环境相关基因在骨肉瘤治疗中的预后价值（英文）

王栋; 邓庆; 彭毅; 仝昭宸; 李梓昕; 黄力平; 曾晋; 李劲松; 苗惊雷; 陈世杰

中南大学学报（医学版） ›› 2024, Vol. 49 ›› Issue (05) : 758 -774.

王栋, 邓庆, 彭毅, 仝昭宸, 李梓昕, 黄力平, 曾晋, 李劲松, 苗惊雷, 陈世杰

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摘要

目的：骨肉瘤是一种极具侵袭性的原发性恶性骨肿瘤，多见于儿童和青少年，预后差。矢巢凋亡(anchorage-dependent cell death,anoikis)已被证明在肿瘤转移中具有重要作用，可调节肿瘤细胞在原发部位的迁移和黏附。作为一种程序性细胞死亡的形式，anoikis在骨肉瘤中的研究较少，尤其是在肿瘤免疫微环境中的研究。本研究旨在阐明anoikis和肿瘤免疫微环境相关基因在骨肉瘤治疗中的预后价值。方法：从GeneCards中获得anoikis相关基因(anoikis-related genes,ANRGs)；从产生有效疗法的治疗应用研究和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中获取骨肉瘤患者的临床信息和ANRGs表达状况。利用估计包和加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis,WGCNA)算法识别出与肿瘤免疫微环境高度相关的ANRGs；采用机器学习算法构建长期生存预测模型，将样本分为高危组和低危组，并在GEO队列中进行进一步验证。最后，基于来自GEO数据库的单细胞RNA测序，分析骨肉瘤肿瘤微环境中特征基因的功能。结果：51个与肿瘤微环境高度相关的枢纽ANRGs被证实，从中选择3个基因(MERTK、BNIP3、S100A8)构建预后模型。根据肿瘤微环境分析，在免疫细胞激活和免疫相关信号通路方面，高危组和低危组之间的差异均具有统计学意义(均P<0.05)。骨肉瘤微环境中的特征基因被证实通过参与GAS6-MERTK信号通路调控细胞间的串扰。结论：基于ANRGs和肿瘤微环境的预后模型具有良好的预测能力，可为骨肉瘤患者提供更多个性化治疗方案。