ICU碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的毒力基因分布及分子流行病学特征

摘要

目的：碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)携带的耐药基因会限制临床用药选择，其毒力基因也会严重影响患者预后。本研究旨在探讨重症监护室(intensive care unit,ICU)CRKP的毒力基因分布、荚膜血清型及分子流行病学特征，了解ICU中CRKP的感染特点，为ICU有效监测和防控CRKP感染提供科学依据。方法：收集2021年1月至2022年12月广东省人民医院ICU所分离并已确定为CRKP的非重复菌株共40株。采用全基因组测序方法，分析待测菌株耐药基因、毒力基因、荚膜血清型的分布，同时将CRKP基因组7个管家基因序列上传至肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KPN)多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)数据库进行分析，以明确菌株的序列型(sequence typing,ST)。结果：40例ICU CRKP感染患者年龄为(69.03±17.82)岁，且伴有多种基础疾病，临床结局好转和死亡各20例。所分离菌株主要来源于中段尿、肺泡灌洗液等标本。全基因组测序结果显示其主要携带blaKPC-1(29株，72.5%)和blaNDM-1(6株，15.0%)，另有5株同时携带blaKPC-1和blaNDM-1。所携带的毒力基因有多种，其中entA、entB、entE、entS、fepA、fepC、fepG、yag/ecp、ompA等基因的携带率达100%,entD、fimB、iroB、iroD、fes、pla等基因携带率较低。ICU所分离的CRKP以ST11型(27例，67.5%)为主，荚膜血清型以KL64型(29例，72.5%)为主。共检出23例ST11-KL64型CRKP，占57.5%。结论：ICU CRKP主要为ST11-KL64型，并携带多种毒力基因，其中以铁吸收类毒力基因为主；且blaKPC已由blaKPC-2转为blaKPC-1。因此，需密切监测CRKP的分子流行病学变化，同时制订严格的防控措施，有效遏制CRKP感染的发生。

关键词

重症监护室 / 碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌 / 全基因组测序 / 毒力基因 / 荚膜血清型 / 多位点序列分型 / 分子流行病学

基金资助

广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515220022)