MICA基因多态性及其单核苷酸多态性位点与玫瑰痤疮易感性的相关性

摘要

目的：主要组织相容性复合体I类链相关基因A（major histocompatibility complex class I chain-related gene A,MICA）是人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）基因的重要组成部分，其基因多态性与肿瘤、自身免疫性疾病等多种疾病的发生和发展密切相关。玫瑰痤疮是一种慢性炎症性皮肤病，其发病机制复杂，与遗传、自身免疫异常等因素有关。本研究分析MICA基因多态性及其单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）位点与玫瑰痤疮易感性的关系，旨在为玫瑰痤疮的发病机制提供新的见解。方法：收集2017年11月至2019年11月在中南大学湘雅医院皮肤科门诊就诊的84例玫瑰痤疮患者（玫瑰痤疮组）外周血DNA样本，另收集223名健康志愿者（对照组）外周血DNA样本。采用聚合酶链反应-直接测序法（polymerase chain reaction-sequencing-based typing,PCR-SBT）和二代测序（the next-generation sequencing,NGS）技术分析MICA基因多态性分型，并比较2种分型方法的准确性。比较玫瑰痤疮组与对照组MICA等位基因分布频率的差异。对所有MICA多态性分子进行氨基酸聚类分析和SNP位点分析，确定相关连锁SNP位点，并对MICA多态性分子进行分类。比较玫瑰痤疮组与对照组不同分类MICA多态性分子的分布频率差异。结果：玫瑰痤疮患者血生化检测结果以中性粒细胞计数轻度升高为主要特征，淋巴细胞计数无显著变化。PCR-SBT和NGS均能准确地鉴定MICA等位基因分型，其中MICA*010:01、MICA*008:04和MICA*019:01是玫瑰痤疮组最常见的等位基因；玫瑰痤疮组等位基因MICA*002:01、MICA*027分布频率均低于对照组（6.55%vs 18.16%、 1.19%vs 5.38%）, MICA*009:01、 MICA*010:01分布频率均高于对照组（7.74%vs 3.36%、 31.55%vs18.61%），差异均有统计学意义（均P<0.05）。本研究检测到5种短串联重复序列（short tandem repeats,STR）等位基因，其中玫瑰痤疮组MICA-A4、MICA-A9分布频率均低于对照组（16.07%vs 23.32%、7.74%vs 17.26%）,MICA-A6分布频率高于对照组（10.12%vs 4.03%），差异均有统计学意义（均P<0.05）。通过氨基酸序列聚类分析和SNP位点分析发现MICA基因存在6个连锁SNP位点，并据此将MICA多态性分子分为Ⅰ型(C₃₆+M₁₂₉+K₁₇₃+G₂₀₆+W₂₁₀+S₂₁₅)和Ⅱ型(Y₃₆+V₁₂₉+E₁₇₃+S₂₀₆+R₂₁₀+T₂₁₅)。玫瑰痤疮患者I型MICA多态性分子与玫瑰痤疮易感性密切相关。结论：MICA基因多态性与玫瑰痤疮易感性相关。MICA基因存在6个连锁SNP位点，可据此将MICA多态性分子分为I型和II型，其中I型与玫瑰痤疮发病密切相关。

关键词

主要组织相容性复合体Ⅰ类链相关基因A / 人类白细胞抗原 / 玫瑰痤疮 / 等位基因 / 基因多态性 / 单核苷酸多态性 / 聚合酶链反应-直接测序法 / 二代测序 / 短串联重复序列