多组学分析揭示AFAP1L1作为胶质瘤预后标志物及免疫相关治疗靶点的作用（英文）

摘要

目的：肌动蛋白丝相关蛋白1样1(actin filament-associated protein 1 like 1,AFAP1L1)是一种接头蛋白，虽然其缺乏酶活性和转录活性，但AFAP1L1基因是结直肠癌和胃癌的原癌基因。本研究旨在探究AFAP1L1在胶质瘤中的作用，探讨AFAP1L1在胶质瘤疾病进展过程中的表达变化。方法：从癌症基因组图谱(The Cancer Gene Atlas,TCGA)、中国胶质瘤基因组图谱(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中下载胶质瘤患者的临床和转录组数据，探讨AFAP1L1表达与胶质瘤预后、体细胞突变、免疫细胞浸润和富集通路之间的关联。通过蛋白质印迹法和实时聚合酶链反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)检测胶质瘤患者中AFAP1L1信使RNA(messengerRNA,m RNA)和蛋白质的表达。结果：高表达AFAP1L1的患者预后较差，AFAP1L1是胶质瘤的独立风险因素。此外，高表达AFAP1L1的胶质瘤患者体细胞突变水平较低，其中包括表皮生长因子受体等致癌基因的扩增和CDKN2A等抑癌基因的缺失。ESTIMATE(Estimation of STromal and Immune cells in Malignant Tumours using Expression)算法分析结果表明，AFAP1L1与免疫微环境呈正相关。肿瘤免疫功能障碍和排斥分析结果表明，高表达AFAP1L1的胶质瘤患者对免疫疗法的反应较差。单细胞分析结果表明，AFAP1L1的表达主要集中在胶质瘤细胞中。富集分析结果表明，AFAP1L1与小三磷酸鸟苷酶(guanosine triphosphatases, GTP酶)、缺氧诱导因子-1(hypoxia-induciblefactor-1, HIF-1)、黏着斑和丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路之间存在潜在联系。结论：AFAP1L1为预示胶质瘤进展的新生物标志物和胶质瘤的潜在治疗靶点。

关键词

低级别胶质瘤 / 胶质母细胞瘤 / 肌动蛋白丝相关蛋白1样1 / 免疫微环境 / 单细胞RNA测序