梅尼埃病与前庭性偏头痛共表达基因特征及天麻素的分子对接预测

摘要

目的 探讨运用生物信息学分析方法对梅尼埃病(meniere's disease, MD)和前庭性偏头痛(vestibular migraine, VM)的共表达基因特征进行初步探索，筛选核心共表达基因。利用分子对接技术预测天麻素对核心共表达基因的治疗潜力。方法 从GEO数据库得到MD和VM的微阵列数据并进行加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis, WGCNA)和差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)分析。通过CTD和GeneCards公共数据库筛选MD和VM共表达基因进行补充。运用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集分析。通过STRING在线数据库构建的蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)筛选核心共表达基因。将天麻素与核心共表达基因进行分子对接预测。结果 共获得92个MD和VM共表达基因。富集分析显示两种疾病都表现出显著的免疫和炎症反应病理特征。MD和VM共同病理机制可能与TNF、IL-17和NF-kB信号通路有关。6个核心共表达基因有TNF、IL-1Β、IL6、ITGAM、CXCL10和MMP9,它们同样具有免疫炎症特征。天麻素与它们的结合亲和力分别为-6.59、-6.50、-4.80、-6.00、-5.59和-8.47 kcal/moL。结论 免疫和炎症反应是MD和VM的共同病理基础，支持这两个疾病之间的相关性。TNF和NF-kB信号通路可能在共同病理机制中发挥重要作用。TNF、IL-1Β、IL6、CXCL10和MMP9可能是MD和VM潜在的共同诊断和治疗靶点。天麻素与它们结合力较强，具有一定治疗潜力。

关键词

梅尼埃病 / 前庭偏头痛 / 共表达基因特征 / 天麻素 / 分子对接