单细胞测序分析喉鳞状细胞癌细胞RPN2表达模式

摘要

目的 探讨核糖体结合糖蛋白Ⅱ(ribophorinⅡ, RPN2)在喉鳞状细胞癌单细胞微环境中的表达模式。方法 通过获取并预处理GSE150321的喉鳞癌单细胞数据集，应用降维和分群算法对细胞类型进行分类和定义，并对各细胞类型中的RPN2表达进行概览和分析。筛选出RPN2阳性和RPN2阴性肿瘤细胞的差异表达基因，进行功能富集分析，构建RPN2阳性和RPN2阴性肿瘤细胞的细胞互作网络。结果 喉鳞状细胞癌细胞经单细胞测序后，根据细胞的标记分子将细胞分为肿瘤细胞、免疫细胞、成纤维细胞、内皮细胞和上皮细胞等亚群。RPN2在肿瘤细胞和免疫细胞中的表达水平相对较高，而在内皮细胞、成纤维细胞和上皮细胞中的表达水平相对较低。差异表达分析筛选出与RPN2表达相关的基因，功能富集分析结果显示RPN2阳性肿瘤细胞高表达基因主要富集在核糖核蛋白复合体的生物发生和胞质翻译等信号通路中。构建的细胞互作网络显示RPN2阳性肿瘤细胞与成纤维细胞、内皮细胞和免疫细胞之间存在较强的互作关系。结论 本研究揭示了RPN2在喉鳞状细胞癌微环境中的表达模式，以及RPN2阳性和RPN2阴性肿瘤细胞的特征及其与肿瘤发病、发展、预后之间的关联。这些发现为喉鳞状细胞癌的治疗和进一步研究提供了理论依据。

关键词

喉鳞状细胞癌 / 单细胞测序 / 核糖体结合糖蛋白Ⅱ / 微环境 / 细胞互作网络