单细胞测序分析小鼠耳蜗螺旋神经节与内外毛细胞间的细胞信号通路

摘要

目的 研究在耳蜗听力形成期和成熟期小鼠耳蜗的细胞群以及调控螺旋神经节细胞和内外毛细胞间信号通路表达的配受体。方法 通过收集公共数据库小鼠耳蜗单细胞测序数据，并利用CellChat软件研究内外毛细胞与临近细胞潜在的细胞与细胞间相互作用。结果 Seurat分析显示小鼠耳蜗具有15群主要的细胞类型，分别是成纤维细胞、Hensen细胞、鼓膜边界细胞、Coch+/Spp1+成纤维细胞、内外沟细胞、内侧指状细胞/内侧边界细胞、外毛细胞、Reissner膜、巨噬细胞、梭形细胞/根细胞、螺旋神经节、中间细胞、施万细胞/卫星胶质细胞、内毛细胞、红细胞。CellChat通讯分析揭示出P14小鼠耳蜗内外毛细胞和螺旋神经节间的通讯关系主要由Bdnf/Ntrk2信号通路介导，P28时期主要由Ggf6/(Bmpr1a+Bmpr2)、Bmp6/(Bmpr1a+Bmpr2)、Ntf3/Ntrk3、Ntf3/Ntrk2以及Spp1/Cd44、Spp1/(Itgav+Itgb1)、Pdgfa/Pdgfra、Gas6/Tyro3信号通路介导。结论 本研究基于单细胞转录组数据，初步识别出在耳蜗听力形成期和成熟期螺旋神经节细胞和内外毛细胞间特异性的配受体。

关键词

单细胞测序 / 螺旋神经节 / 毛细胞 / 细胞间通讯