柱式法和磁珠法提取原油脱氧核糖核酸

摘要

直接提取原油脱氧核糖核酸（DNA）是分析原油微生物群落和多样性最基础、最重要的第一步。分别用柱式法（SE）和磁珠法（ME）提取12份原油样品的微生物基因组总DNA,并通过因美纳（Illumina）高通量测序进一步分析其微生物多样性和群落差异。结果表明：SE的DNA质量浓度和纯度(A₂₆₀/A₂₈₀比值，其中A为吸光度)分别为20.17±31.83 ng/μL和1.01±0.63,ME的DNA质量浓度和纯度分别为11.14±17.27 ng/μL和1.29±0.20;SE检出30门和507属，ME检出38门和677属，其中未分类属和未培养属的相对含量分别为1.12%和0.20%（SE）、1.24%和1.10%（ME）;两种方法均检测到专有属（SE专有65属，ME专有235属）,SE检出油藏微生物如地杆菌属（Geobacter）等，ME检出疑似油藏微生物如黄杆菌属（Xanthobacter）;两种方法在原油DNA提取方面各有优劣，SE提取质量浓度高并对油藏微生物有更好响应，ME检测微生物多样性能力略强，但两种方法在分类学水平上均有较强的偏向性。

关键词

DNA提取 / 柱式法 / 磁珠法 / 微生物多样性 / 微生物群落

基金资助

中国石油战略合作科技专项(ZLZX2020010805,ZLZX2020020405); 中国石油大学(北京)前瞻导向项目(ZX20190209);中国石油大学(北京)地层微生物资源与应用研究中心多学科联合创新创业实验室(第四批)项目; 国家科技重大专项(2016ZX05050011,2016ZX05040002)