植物IPP基因的生物信息学分析

摘要

异戊烯基焦磷酸异构酶（IPP）催化异戊烯焦磷酸与二甲基丙烯基焦磷酸（DMAPP）的可逆异构化反应，对下游萜类产物的合成发挥重要作用。该研究利用生物信息学方法，从稻（Oryza sativa）与拟南芥（Arabidopsis thaliana）等单、双子叶植物基因组中鉴定获得31条IPP基因。系统进化树将IPP分为3簇，其中单子叶植物单独形成一簇，同簇的IPP成员具有相似的结构域，可能执行相似的生物学功能；以稻与拟南芥IPP基因为代表，顺式调控元件分析显示它们含有干旱等响应元件；定量PCR结果显示，稻与拟南芥IPP转录水平的表达模式较为多样化。研究结果为系统认识IPP基因的生物学作用及可能的应用研究提供了理论依据。

关键词

异戊烯基焦磷酸异构酶 / 生物信息学 / 干旱胁迫 / 脱落酸 / 表达模式