基于网络药理学、基因表达综合数据库和分子对接对西黄丸治疗胃癌作用机制的分析

摘要

目的 基于网络药理学、基因表达综合数据库（GEO）芯片及分子对接探讨西黄丸在基因水平上治疗胃癌的潜在机制。方法 通过中药和基因数据库平台获得西黄丸有效活性成分及药物靶点，构建“中药-活性成分-潜在作用靶点”调控网络；利用疾病基因网络、GeneCards、美国国立生物技术信息中心、在线人类孟德尔遗传数据库结合GEO芯片收集并筛选胃癌的治疗靶点；通过R软件分析西黄丸药物靶点与胃癌治疗靶点的交集，构建交集靶点互作网络；对交集靶点进行GO和KEGG富集分析，并通过分子对接技术评估活性成分与靶基因之间的结合能力。结果 共获得西黄丸46种主要活性成分，包括槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇和鞣花酸等。TP53、PTGS2、IL6、CASP3和MMP9为排名前5位的关键基因，主要涉及肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、白介素-17（IL-17）信号通路、肿瘤中的蛋白聚糖通路的信号通路。PTGS2和IL6基因表达水平与胃癌预后显著相关（χ²=4.000,P=0.046;χ²=6.760,P=0.010）,PTGS2和CASP3能够与药物活性成分稳定结合。结论 西黄丸主要通过TP53、PTGS2、IL6、CASP3和MMP9关键基因调控TNF信号、IL-17信号和蛋白聚糖等多种通路治疗胃癌，其中PTGS2介导的TNF信号通路可能在这一机制中起核心作用。

关键词

西黄丸 / 网络药理学 / 胃癌 / 富集分析 / 分子对接 / 分子机制

基金资助

湖北陈孝平科技发展基金会专项项目(CXPJJH125004-108)