基于网络药理学和分子对接分析蒲公英的抗胃癌机制

摘要

目的：通过网络药理学预测蒲公英抗胃癌的活性成分和主要靶点，探析其治疗胃癌的作用机制。方法：采用TCMID、PubChem以及Swiss Target Prediction等数据库检索蒲公英的潜在活性成分，预测蒲公英潜在的作用靶点。利用OMIM、Genecards、Drugbank数据库检索胃癌相关靶点，将蒲公英作用靶点与胃癌相关靶点进行交集，明确药物-疾病共同靶点。将共同靶点导入STRING数据库分析蛋白互作关系，Cytoscape 3.9.1构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图，Network Analyzer分析核心靶点。利用R软件使用Bioconductor对共同靶点进行基因本体（gene ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析。根据Degree值排序，分别取前4个主要活性成分及核心靶点采用AutoDock软件进行分子对接分析。结果：获得药物潜在活性成分65个，药物靶点577个，疾病靶点1 517个，药物-疾病共同靶点118个。经分析得蒲公英中主要活性成分为artemetin、quercetin、luteolin、 myricetin、hesperetin、coniferyl aldehyde、esculetin等，蛋白核心靶点为STAT3、SRC、MAPK3、HSP90AA1、PIK3R1、MAPK1、PIK3CA等。GO分析结果获得2 402条生物过程、91条细胞组分及168条分子功能相关过程通路。KEGG分析获得163条KEGG通路。分子对接结果显示Degree值前4的主要活性成分与核心靶点的分子对接结合能均低于-5 Kcal·mol^-1，表明结合活性较高。结论：蒲公英可通过多成分、多通路、多靶点发挥抗胃癌作用，为进一步探讨蒲公英的抗胃癌机制提供了依据。

关键词

网络药理学 / 蒲公英 / 胃癌 / 分子对接

基金资助

河北省医学科学研究课题计划项目（No.20220582）; 张家口市科技计划项目（No.2121082D）