网络药理学与分子对接联合解析赤芍抗宫颈癌的关键靶点及信号通路机制

摘要

目的：通过网络药理学和分子对接技术预测宫颈癌（cervical cancer,CC）的靶点以及研究赤芍抑制CC侵袭转移能力的作用和机制。方法：先通过TCMSP数据库检索赤芍的化学成分并且通过Swiss Target Prediction数据库预测赤芍的作用靶点。再通过GeneCards数据库获取CC的靶点。借助韦恩图获取药物靶点与疾病靶点的共同靶点后，再通过STRING数据库构建这些靶点蛋白之间的相互作用网络。并用Cytoscape软件构建中药-化合物-靶点-疾病网络再进行分析。利用DAVID数据库进行富集分析和KEGG通路分析。得到关联度较高的九个蛋白进行分子对接。通过Uniport和PDB数据库下载关键蛋白的分子结构。利用AutodockVina进行关键蛋白与小分子的对接，利用Pymol对对接结果进行可视化。结果：赤芍筛选出了12个有效成分和352个靶点。宫颈癌筛选出2 499个疾病靶点。通过韦恩图筛出了175个交集靶点。PPI分析确定了EGFR、BCL2、AKT1、CASP3、STAT3、JUN、HSP90AA1、MMP9、HIF1等关键靶点与赤芍抑制宫颈癌的作用相关。GO富集得到了671条生物过程，179条分子功能和94条细胞组分的信息。KEGG得到了151条通路。分子对接和可视化的结果显示EGFR、HSP90AA1、SOS、KRAS等关键靶点有较强的结合能力。结论：网络药理学展现出赤芍对于治疗宫颈癌的多种方法多个通路多个有效成分，揭示了赤芍可能通过RAS-ERK信号通路对抑制宫颈癌血管内皮细胞异常生长有重要作用。

关键词

网络药理学 / 赤芍 / 宫颈癌 / 分子对接