肺腺癌中HPRT1基因表达对患者总生存的影响

摘要

目的 探索HPRT1基因在肺腺癌中的表达特征、总生存率、功能激活以及免疫浸润中的影响。方法 通过对TCGA肺腺癌数据以及多个GEO数据库中的肺腺癌数据进行挖掘分析，对比并验证HPRT1表达量与预后总生存（overall surival,OS）的关系，通过cluster Profiler分析HPRT1基因高表达组中上调基因的功能富集情况。且通过TIMER以及CIBERSORT算法计算肺腺癌中不同免疫细胞的浸润水平并对比在HPRT1高低表达组间的浸润程度差异。结果 HPRT1在肺腺癌组织中表达量显著上调，且在TCGA中证明HPRT1基因高表达的患者预后OS更差（P <0.01）。经过2个GEO数据集的验证同样发现HPRT1基因高表达表现为预后OS更差（GSE13213,P <0.01;GSE67639,P <0.001）。差异分析显示高表达的患者中有683个基因的表达量显著上调且这些上调基因的功能主要富集与p53以及细胞周期等癌症相关的信号通路。TIMER以及CIBERSORT算法进行的免疫细胞浸润程度分析发现在高表达差预后人群中B细胞以及CD4T细胞含量均更低（P <0.05）。结论 HPRT1基因表达量越高肺腺癌患者的总生存越差，且高表达患者的p53信号通路上调，B细胞以及CD4T细胞浸润程度显著下降。

关键词

肺腺癌 / HPRT1基因 / 总生存 / 数据挖掘