早发性脊柱侧凸合并胸廓发育不良综合征幼猪模型的肺发育相关分子分析

摘要

目的 基于已建立的早发性脊柱侧凸合并胸廓发育不良综合征（EOS+TIS）幼猪模型及治疗模型获取组织标本，进行转录组测序，生物信息学分析。筛选出影响肺发育相关的部分HUB基因。方法 建立EOS+TIS及治疗动物模型，进行HE及Masson染色观察肺组织形态及纤维化程度，并对3组（对照组、模型组、治疗组）肺组织测序。利用R软件的DESeq2进行差异分析，运用DAVID数据库进行差异基因的GO/KEGG富集分析，筛选核心基因，预测相关通路，并通过PCR和免疫印迹实验进行验证。结果 （1）HE染色结果：模型组肺组织体现了显著的支气管肺发育不良，治疗组获得明显改善；Masson染色结果：模型组肺纤维化程度较重，治疗组减轻；（2）DESeq2分析表明，正常组与模型组有170个上调和262个下调基因，而模型组与治疗组有323个上调和467个下调基因；（3）GO功能注释显示差异基因主要富集在细胞外基质、质膜组成、免疫应答、炎症反应、钙离子结合、细胞因子活性等功能。KEGG显示差异基因主要富集在神经活性配体-受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用等通路；（4）筛选出共同基因THBS1;(5)PCR和Western Blot实验验证，THBS1在模型组中下调，治疗后上调（P <0.05），使用Western Blot实验检测TGF-β在3组中的表达量，模型组下降，治疗后上升（P <0.05）。结论 THBS1与TGF-β参与了早发性脊柱侧凸合并胸廓发育不良综合征幼猪模型的肺发育变化过程。

关键词

早发性脊柱侧凸 / 胸廓发育不良综合征 / 生物信息分析 / THBS1 / TGF-β