胃腺癌患者铁死亡相关LncRNA预后模型的构建

摘要

目的 研究胃癌细胞铁死亡相关Lnc RNA，建立预测胃腺癌患者的生存预后情况的预后模型，为其生物标志物与治疗靶点的开发提供理论依据。方法 对TCGA数据库中的胃腺癌患者的转录本测序数据进行分析，并与铁死亡相关基因取交集，通过共表达和差异分析方法，从而筛选出与铁死亡相关的Lnc RNA。采用单因素和多因素Cox回归分析，筛选出与胃腺癌患者预后相关的Lnc RNA，从而建立预后评分模型。在此基础上，对每一样本进行风险值计算，并对模型的可靠性进行充分验证；根据模型结果对高低风险组之间进行免疫浸润与免疫反应等差异分析。结果 肿瘤组织中相较正常组织筛选到与铁死亡相关的503个Lnc RNA （上调431个，下调72个）；单因素Cox回归分析得出33个可作为独立风险因子的Lnc RNA，而多因素Cox回归分析构建出一个由17个Lnc RNA组成的预测模型。生存曲线表明高风险的患者比低高风险的患者的存活率显著降低（P <0.001）；单因素和多因素独立预后分析表明，年龄、分期与风险值是患者的独立危险因素；时间依赖的ROC曲线提示，模型的1,2,3年生存率预测AUC值为0.751,0.799,0.779，证明模型具备可靠与稳定性。高低风险组间多个免疫激活反应、免疫细胞的浸润程度与免疫检查点的表达水平存在显著差异（P <0.001）。结论 以铁死亡相关lnc RNA为基础，建立胃腺癌患者预后预测模型，可较好地评估患者预后情况，纳入模型的Lnc RNA具备开发为生物标志物与治疗靶点的可行性。

关键词

胃腺癌 / 铁死亡 / LncRNA / 预后模型