基于单细胞核测序的肝癌细胞组成及其演化路径研究

摘要

目的：基于单细胞核测序探讨肝癌的细胞组成并揭示其演化过程。方法：收集2020年5月至2022年3月深圳市龙岗区人民医院5例肝癌患者术后切除样本，包括癌与癌旁组织，通过单细胞核测序分离鉴定细胞组成，采用特异性的细胞标志物细分细胞类型，并选取特定基因和信号通路预测其演化过程。结果：通过5例肝癌样本的单细胞核测序分析发现，肝癌细胞组分主要包括肝实质细胞（68.35%）、胆管细胞（6.3%）、内皮细胞（6.55%）、肝星状细胞（3.9%）、髓系细胞（6.8%）、T/NK/B细胞（7.6%）以及其他未定义细胞（0.5%）。髓系细胞中的巨噬细胞高表达分泌型磷蛋白1(SPP1)和糖蛋白nmb(GPNMB)。肝星状细胞存在部分表达肝细胞生长因子（HGF）基因的细胞，且存在高表达成纤维细胞活化蛋白（FAP）的癌相关成纤维细胞。内皮细胞高表达细胞周期调节因子（RGCC）基因。混合癌中存在胆碱激酶表达下调而上皮细胞黏附分子（EPCAM）的表达上调的胆管癌细胞。KEGG信号通路分析发现差异表达基因（DEGs）主要参与代谢相关通路。结论：单细胞核RNA测序揭示肝癌由7种细胞构成，在不同的肝癌类型中比例略有差异，每种细胞具有促进肿瘤发展的相关基因表征，信号通路分析发现肝癌与代谢通路密切相关。

关键词

单细胞核RNA测序 / 癌,肝细胞 / 细胞组成 / 代谢通路 / 演化