基于TCGA数据库分析ABAT在肝细胞癌诊断及预后中的价值

摘要

目的 探索4-氨基丁酸氨基转移酶（ABAT）在肝细胞癌诊断及预后中的价值，并构建肝细胞癌患者生存预测列线图。方法 ABAT表达和临床数据来自癌症基因组图谱数据库（TCGA）。采用χ²检验或Fisher确切概率法分析ABAT表达与临床特征之间的关联。基于TCGA和人类蛋白质图谱数据库（HPA）分析ABAT在肝细胞癌及正常肝组织中的表达差异。受试者工作特征曲线用于分析ABAT在肝细胞癌中的诊断价值。单变量及多变量Cox回归和KaplanMeier生存分析用于探索ABAT在肝细胞癌中的预后价值。基因集富集分析（GSEA）用于探索与ABAT表达相关的分子通路。基于ABAT表达和其他预后因素构建列线图预测肝细胞癌患者1、3、5年生存率。结果 ABAT在肝细胞癌中显著低表达，并且与年龄、种族、病理分级、Stage分期、T分期显著相关。在TCGA肝组织转录组数据中，ABAT表达对HCC组织与正常肝组织具有较高区分能力，曲线下面积达0.942。多变量Cox回归表明ABAT是肝细胞癌独立的预后因素。基于ABAT表达构建的列线图对肝细胞癌患者1、3、5年生存率的预测具有较好的准确性和临床实用性。GSEA分析表明ABAT高表达与多种代谢相关通路密切相关。结论 ABAT有望成为肝细胞癌组织表达层面的候选生物标志物。

关键词

肝细胞癌 / 4-氨基丁酸氨基转移酶 / 列线图 / 肿瘤代谢