子宫内膜癌中PDZRN3的表达特征及其生物信息学评估

摘要

目的 利用生物信息学评估E3泛素连接酶(PDZ domain containing ring finger 3,PDZRN3)在子宫内膜癌中的表达特征。方法 利用TIMER2和仙桃学术(https://www.xiantao.love/)分析子宫内膜癌组织和子宫内膜组织中PDZRN3的表达差异。根据TCGA数据库中子宫内膜癌患者的临床信息，使用R软件的stats包创建基线资料表；使用stats包、car包与ggplot2包进行临床分期和病理分级的分析；使用survival包和survminer包，采用Kaplan-meier法绘制生存分析曲线；使用survivalR包分析COX比例风险模型并制作COX回归分析表格；使用R软件中pROC包和survival包创建诊断ROC曲线和列线图模型。体外培养子宫内膜癌AN3CA和Ishikawa细胞株，蛋白质印迹实验检测PDZRN3在2种细胞株中的蛋白表达情况。结果 TIMER2数据库和仙桃学术分析显示PDZRN3在子宫内膜癌组织中低表达(P<0.05)。TCGA数据库表明PDZRN3的表达与临床分期，组织学分级和组织学类型明显相关(P<0.05),PDZRN3表达较高的子宫内膜癌患者有较高的总生存期(overall survival, OS),疾病特异性生存期(disease specific survival, DSS)和无进展间隔期(progress free interval, PFI),反之，PDZRN3表达较低的子宫内膜癌患者OS、DSS、PFI较低。单因素和多因素COX回归分析均显示，子宫内膜癌患者PDZRN3的表达、年龄、临床分期、病理分级是影响预后的危险性因素(P<0.05)。ROC曲线结果显示，PDZRN3表达可以帮助区分肿瘤组织和非肿瘤组织(AUC:0.865),列线图模型可用于预测临床患者1年、3年、5年的生存概率。Western Blot结果表明，PDZRN3在子宫内膜癌细胞株AN3CA中高表达(P<0.01),在子宫内膜癌细胞株Ishikawa中低表达(P<0.01)。结论 PDZRN3作为一种极具潜力的生物标志物，有望在子宫内膜癌患者的分层、预后评估和治疗干预中发挥重要作用。

关键词

E3泛素连接酶 / 子宫内膜癌 / 生物信息学