MAP4K1于泛癌中的突变、转录与免疫调控图谱

车思函, 薛浩楠, 刘兴宇, 勾霜, 刘琳, 张瑶, 徐乾, 李子一, 杜富宽

西南医科大学学报 ›› 2024, Vol. 47 ›› Issue (05) : 395 -404.

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MAP4K1于泛癌中的突变、转录与免疫调控图谱

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摘要

目的 探讨MAP4K1基因在泛癌中的表达、突变、预后影响和免疫浸润,并考察其作为免疫疗法新靶点的潜力。方法 利用UCSC数据库中的泛癌数据集与GEPIA 2数据库,探究MAP4K1的表达差异和生存率关系。小提琴图展示MAP4K1在泛癌与正常组织中的差异;Kaplan-Meier曲线评估生存关联。此外,还进行了实时荧光定量PCR测定MAP4K1 mRNA水平,cBioPortal网站分析基因突变和编码顺序变化,TIMER1.0网站探索免疫浸润联系。结果 MAP4K1基因在大多数泛癌组织中的表达量高于正常组织,MAP4K1 m RNA在胰腺癌和急性髓性白血病细胞中明显高表达;而在卵巢癌细胞,黑色素瘤细胞,胶质瘤细胞中低表达,与肿瘤纯度负相关、免疫浸润正相关。基因改变频率为2.9%,以扩增和深度缺失为主,子宫内膜癌等癌症中突变频率高。此外,MAP4K1在泛癌中一共有156处突变,其中错义突变为主要类型。MAP4K1的表达与生存期关系复杂,既可能与较长生存期相关,也可能预示较短生存期。结论 本研究探究了MAP4K1在多种癌症发生和发展中的重要作用,揭示了其在癌症治疗中作为潜在靶标的可能性。这些发现能为癌症免疫治疗策略的发展提供一定的参考,可能对未来癌症治疗方法具有借鉴意义。

关键词

MAP4K1 / 泛癌 / 免疫浸润 / 预后

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车思函, 薛浩楠, 刘兴宇, 勾霜, 刘琳, 张瑶, 徐乾, 李子一, 杜富宽 MAP4K1于泛癌中的突变、转录与免疫调控图谱[J]. 西南医科大学学报, 2024, 47(05): 395-404 DOI:

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