新生与成年大鼠心脏成纤维细胞来源外泌体蛋白质组学差异分析

摘要

目的 幼体心脏具有再生修复功能，通过分析新生大鼠与成年大鼠心脏成纤维细胞来源外泌体的差异蛋白，从分子水平上探讨心肌受损后可能的治疗靶点。方法 分别从新生和成年大鼠心脏成纤维细胞中分离出外泌体，并提取蛋白质进行高效液相色谱法（high performance liquid chromatography,HPLC）和液相色谱串联质谱法（liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry,LC-MS/MS）分析，鉴定差异表达的蛋白质。使用DAVID数据库对差异表达蛋白基因进行基因本体论（Gene Ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析。并进一步使用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质相互作用网络（protein-protein interaction,PPI）分析，以筛选出关键基因。结果 在新生大鼠中共发现241个差异表达蛋白，其中上调表达的蛋白有117个，下调表达的蛋白有124个。GO分析显示上调表达基因主要涉及整合素介导的信号通路和对缺氧的反应，而对内肽酶活性负调控的基因下调表达。KEGG分析结果表明上调表达基因主要富集于Hippo信号通路，而下调表达基因主要涉及细胞外基质与受体相互作用。通过PPI分析得出有6个关键基因（Lamc1、Agrn、Itih3、Tfrc、Bgn和Atp5pd）下调，有1个关键基因（Rp17a）上调。结论 通过蛋白组学和生物信息学方法，筛选出了新生大鼠和成年大鼠心脏成纤维细胞来源外泌体的差异蛋白，以及相关的信号通路和关键基因，为心肌受损精准治疗提供了潜在的靶点。

关键词

新生大鼠 / 心脏成纤维细胞 / 外泌体 / 蛋白质组学