盐酸丁卡因诱导的巨噬细胞转录组变化及可变剪接事件分析

摘要

目的 探究盐酸丁卡因对巨噬细胞基因表达谱及其对RNA可变剪接（alternative splicing,AS）的影响。方法 采用转录组测序技术对盐酸丁卡因（200μM）处理24 h的小鼠巨噬细胞（RAW 264.7）进行分析。筛选差异表达变化超过2倍的m RNA，并通过生物信息学工具进行基因本体（gene ontology,GO）功能分类、京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集、反应途径分析及差异AS事件分析。结果 经丁卡因处理RAW 264.7后，共识别出差异表达基因52 119条，包括1 785条上调基因和1 454条下调基因。GO分析显示主要富集在DNA复制中的DNA解旋、T细胞趋化、DNA复制起始和DNA双链解旋等生物过程。KEGG通路分析揭示主要富集通路包括核糖体、新冠肺炎、氧化磷酸化、细胞周期、p53信号通路和动物线粒体自噬等。Reactome富集到无义介导的mRNA降解、信号识别颗粒（signal recognition particle,SRP）依赖的共翻译蛋白质靶向膜、rRNA加工等途径。基因集富集分析（gene set enrichment analysis,GSEA）显示免疫炎症反应和p53通路等被激活，而细胞周期通路被抑制。差异AS分析指出丁卡因处理显著影响巨噬细胞的AS事件。结论 局麻药丁卡因显著影响了巨噬细胞的基因表达谱，差异基因与DNA损伤修复、细胞周期、免疫应答、r RNA加工、RNA无义降解等密切相关，同时丁卡因也显著影响了巨噬细胞中的基因AS过程。

关键词

局麻药 / 盐酸丁卡因 / 巨噬细胞 / 转录组 / 差异基因

基金资助

泸州市人民政府-西南医科大学科技战略合作项目（2021LZXNYD-D08）; 四川省大学生创新创业训练计划项目（S202310632238）