大菱鲆SoxB1亚族基因的鉴定及表达分析

摘要

SoxB1亚族是Sox基因家族中古老的一支，它通过与DNA特异性结合的HMG盒来调控下游靶基因表达，在生物体多种生命过程如神经发育和干细胞多能性维持中，发挥着重要作用。从大菱鲆基因组中鉴定出5个SoxB1亚族基因，分别是SmSox1a,SmSox1b,SmSox2,SmSox3及SmSox19。研究发现SoxB1亚族基因在进化过程中具有高度同源性，将大菱鲆与其他物种的SoxB1亚族基因HMG-box进行系统发育分析，结果支持了对SoxB1亚族基因的分类。利用基因结构分析检测到大菱鲆SoxB1亚族基因可分为没有内含子、1个内含子和2个内含子3大类。HMG盒序列保守性分析发现，同一亚族的HMG盒保守性超过80%。SoxB1亚族基因表达模式分析结果表明，大菱鲆SoxB1基因在不同组织中呈现多元的表达模式，意味着其在执行功能时出现组织特异性。该发现有助于进一步了解海洋硬骨鱼类SoxB1亚族基因的功能和进化。

关键词

SoxB1亚族基因 / 大菱鲆 / 基因结构 / 系统发育分析 / 基因表达模式