基于非靶向代谢组学的晚期Luminal型乳腺癌哌柏西利耐药生物标志物研究

摘要

采用超高效液相色谱-串联质谱（ultra-high-performance liquid chromatography-mass spectrometry,UHPLC-MS/MS）的非靶向代谢组学方法进行代谢物丰度检测和鉴定，结合多元统计方法比较健康对照组、晚期Luminal型乳腺癌（luminal advanced breast cancer,Luminal ABC）哌柏西利耐药组和敏感组患者中代谢谱趋势差异，以变量权重值（variable importance in projection,VIP）>1、P<0.05和差异倍数（fold change,FC）>1.2或<0.833标准筛选差异代谢物，对鉴定到的代谢物通过加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）来确定与耐药相关的共表达模块，京都基因与基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路分析和代谢物集富集分析（metabolite set enrichment analysis,MSEA）识别与耐药相关的关键代谢通路和生物学功能。结果显示，共鉴定出583种代谢物，依据筛选标准筛选出54种差异代谢物，通过WGCNA分析构建出8个共表达模块。其中青绿色模块（MEturquoise）与哌柏西利耐药表型显著相关（r=0.46,P<0.05），共包含179种关键代谢物，且有22个关键代谢物同为差异代谢物，即精氨酸和苯丙氨酸等16种显著上调，胆碱和辛酸等6种显著下调。模块内整体代谢物与差异代谢物具有相似的代谢功能和生物学作用（P<0.05）。因此，Luminal ABC患者血清代谢水平与健康人群存在显著差异，结合WGCNA识别哌柏西利耐药相关的差异代谢物，以期为Luminal ABC哌柏西利耐药患者的代谢异常调控提供数据支持和研究依据。

关键词

晚期Luminal型乳腺癌 / 哌柏西利耐药 / 非靶向代谢组学 / 加权基因共表达网络分析