TTK高表达导致导管癌初级纤毛缺失:基于TCGA/GTEx数据库的整合分析

李正阳, 俞鸿玮, 赵慧明, 潘飞飞, 刘昊天, 武乐乐, 石文贵, 焦作义

生物医学转化 ›› 2025, Vol. 6 ›› Issue (03) : 56 -70+79.

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TTK高表达导致导管癌初级纤毛缺失:基于TCGA/GTEx数据库的整合分析

    李正阳, 俞鸿玮, 赵慧明, 潘飞飞, 刘昊天, 武乐乐, 石文贵, 焦作义
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摘要

目的 探究导管癌(乳腺、胰腺及胆管癌)中初级纤毛缺失的机制。方法 通过整合癌症基因组图谱和基因型-组织表达数据库中乳腺导管癌、胰腺导管腺癌和胆管癌及其对应正常组织的转录组数据,筛选差异表达的纤毛相关基因(纤毛成分基因和调控基因)。进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书富集分析、生存分析(单变量Cox回归、KaplanMeier生存曲线)、相关性分析。利用组织芯片免疫组化和免疫荧光在临床样本(胆管癌、乳腺癌)和人肾小管上皮细胞中验证关键因子苏氨酸/酪氨酸激酶(TTK)的蛋白表达、定位及其与预后的关系。结果 在3类导管癌中鉴定出显著差异表达的纤毛相关基因(共同差异纤毛成分基因25个,其中上调10个、下调4个;共同差异纤毛调控基因7个,上调4个;其中TTK归类于共同上调的差异纤毛成分基因)。富集分析显示,纤毛相关差异基因主要涉及纤毛组装、微管运动、刺猬信号通路、泛素-蛋白酶体降解通路等。生存分析显示,TTK高表达是3类导管癌共同的不良预后因子(乳腺导管癌:P=0.045;胰腺导管腺癌:P=0.006;胆管癌:P=0.073),且TTK在乳腺导管癌、胰腺导管、胆管癌中的对数倍数值(log2FC)分别为4.73、3.65、3.16(均P<0.001)均为高表达,同时,TTK蛋白高表达与患者不良预后显著相关(P<0.001)。免疫荧光证实TTK定位于纤毛基体区。相关性分析显示,TTK表达与多个核心纤毛基因显著相关。结论 TTK过表达通过定位于纤毛基体区发挥作用,干扰了纤毛的正常组装,从而影响了导管癌的纤毛缺失,靶向抑制TTK可成为恢复纤毛功能、阻断导管癌进展的新型治疗策略。

关键词

TTK蛋白激酶 / 初级纤毛 / 乳腺癌 / 胰腺肿瘤 / 胆管癌

Key words

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TTK高表达导致导管癌初级纤毛缺失:基于TCGA/GTEx数据库的整合分析[J]. 生物医学转化, 2025, 6(03): 56-70+79 DOI:

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