基于网络药理学及分子对接分析当归-酸枣仁-茯神治疗失眠的作用机制

摘要

目的 检索中药系统药理学平台获取核心组方的生物活性成分，根据ADEM分析，选择药物相似性（drug-likeness,DL）≥0.18和口服生物利用度（oral bioavailability,OB）≥30%为标准的成分收集为核心组方的生物活性成分，将鉴定出来生物活性成分相关的靶标，在Uniprot数据库中进行标准化。方法 通过PharmGKB、DisGeNET、OMIM和GeneCards数据库检索疾病相关靶点。将核心组方活性成分的靶点与疾病靶点取交集得到核心潜在靶点。通过Cytoscape软件构建成分-靶点等多层次网络关联图。使用R软件中的相关数据包（enrichplot、clusterProfiler、ggplot2、Enrichplod、pathview）对交叉靶标进行基因本体（gene ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）功能富集分析。计算相应的P值，并应用错误发现率校正。采用Schr?dinger分子对接软件用于测定配体-蛋白质的相互作用。结果 在满足筛选标准（OB≥30%,DL≥0.18）后，通过TCMSP检索，最终获得核心组方中3种中药的生物活性成分及靶点，同时还发现了52个与这些成分相关的靶标。对疾病靶点预测共检索到6535个与疾病相关的靶标。对核心组方中的生物活性成分的靶点与检索到的疾病靶点通过R软件绘制的Venn图获得了总共48个交叉靶标基因。从GO本体分析结果中获得832个GO项（P<0.05），包括638个生物过程GO项、60个细胞成分GO项、134个分子功能GO项。在KEGG分析中，以P<0.05为阈值，共获得86条信号通路。可以发现核心组方治疗疾病是多靶点、多途径的。结论 通过分析当归-酸枣仁-茯神的多成分、多靶点、多途径及其相关成分-靶点网络效应图，为其治疗失眠的机制研究提供了数据网络支持，也为后期实验研究奠定了基础。

关键词

失眠 / 网络药理学 / 靶点 / 分子对接