丹参LBD26基因的克隆和表达分析

摘要

为了解丹参LBD26转录因子在药效成分积累中的生物学作用，克隆了SmLBD26基因的编码序列，利用生物信息学方法进行序列特征、同源进化及启动子元件分析，通过荧光定量PCR技术检测其组织表达特性及激素和胁迫处理下的表达量。序列特征结果表明，SmLBD26的CDS序列全长为702 bp,编码233个氨基酸。SmLBD26蛋白为不稳定、亲水的核蛋白；其二级结构以无规则卷曲为主，其次是α螺旋、延伸链和β转角。同源与进化分析发现，与LBD蛋白同源性较高，具有LOB结构域，是Ⅱ类LBD转录因子。启动子元件分析结果表明，SmLBD26启动子中含有激素及非生物胁迫应答相关的元件。表达量分析结果显示，SmLBD26基因在根、茎、叶和花中均有表达，且在根中表达量高；经脱落酸、生长素、茉莉酸、4℃和镉处理丹参小苗后SmLBD26的表达均下调，表明SmLBD26基因参与了丹参对激素及不同胁迫的应答。

关键词

SmLBD26蛋白 / 基因克隆 / 生物信息学分析 / 表达分析