茶树GASA基因家族的生物信息学分析

摘要

GASA(Gibberellic acid-stimulated in arabidopsis)是植物特有的转录因子家族，与植物的生长、发育、抗逆密切相关。采用生物信息学方法，基于茶树的全基因组序列，共鉴定到了29个GASA基因，根据染色体排列，编号为CsGASA1—CsGASA29。系统发育分析、保守基序分析、共线性分析、启动子元件分析及表达分析显示：CsGASA分为3个亚家族，编码64～218个氨基酸；共鉴定到6个保守基序；有4个CsGASA来源于片段重复事件，5个CsGASA来源于串联重复事件；有53%的启动子元件与环境响应有关；有部分CsGASA基因受到干旱、低温和盐胁迫调控；CsGASA3基因只在根处具有较高的表达量。

关键词

茶树 / GASA基因 / 进化分析 / 生物信息学分析