酪氨酸氨基转移酶基因在肝细胞癌中诊疗价值及其底物酪氨酸的孟德尔随机化研究

摘要

目的：利用GEO、TCGA和STRING数据集研究酪氨酸氨基转移酶基因（Tyrosine aminotransferase gene,TAT）在肝细胞癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）中的临床价值和潜在功能。方法：使用GEO、TCGA、STRING、LinkedOmics、TargetScan、miRDB、miRWalk和GEPIA数据库分析HCC患者TAT基因表达与预后、临床分期和免疫细胞浸润之间的相关性，并获得了与TAT直接相互作用的分子。免疫组织化学（Immunohistochemistry,IHC）染色证实TAT在HCC中的表达情况。GO和KEGG富集分析TAT在HCC中的潜在作用。通过2个样本的孟德尔随机化分析TAT底物（酪氨酸）与HCC之间的因果关系。结果：IHC证实TAT在HCC样品中显著低表达。共表达和差异分析得到11个共表达基因，这些基因主要参与氨基酸的代谢。其中PCK1、SDS、BHMT、CYP2A6和CTH可与TAT直接相互作用。生存分析显示，TAT、CTH或BHMT低表达患者的总生存率显著降低。发现miR-212对TAT的表达有显著影响。免疫细胞浸润的分析揭示了10种免疫细胞类型，在高和低TAT表达组之间有显著差异。双样本孟德尔分析发现，TAT可能不是直接通过调节酪氨酸水平来抑制HCC。结论：TAT可作为HCC的诊断标志物，为HCC的诊断和治疗提供新的理论依据。

关键词

酪氨酸氨基转移酶 / 肝细胞癌 / 孟德尔随机化

基金资助

国家自然科学基金项目（31960163）; 江西省自然科学基金项目（20212BAB206003）