麝鼠Bad基因生物信息学分析

摘要

B淋巴细胞瘤-2基因相关启动子（Bcl-X_L/Bcl-2 associated death promoter,Bad）是麝鼠（Ondatra zibethicus）香腺miRNA测序筛选出的显著差异miRNA靶基因之一。为了解麝鼠Bad基因的基因结构和生物学功能，探讨其在麝鼠香腺发育和泌香中的作用，通过比对麝鼠的全基因组获得麝鼠Bad基因的CDS区序列，并利用多种在线预测软件进行生物信息学分析。结果表明：麝鼠Bad基因的CDS区全长为615 bp，编码204个氨基酸；编码的蛋白相对分子质量为22 087.40，等电点为9.63，不稳定系数为72.03，平均亲水系数为-0.885，是不稳定的亲水蛋白；无跨膜结构，无信号肽，有26个潜在的磷酸化结合位点。亚细胞定位结果显示，该蛋白主要定位于线粒体。二级结构主要由α-螺旋（32.84%）、无规则卷曲（56.86%）、β-转角（4.90%）和延伸链（5.39%）构成。构建系统发育进化树结果显示，麝鼠与仓鼠科（Cricetidae）亲缘关系最近，说明Bad基因在进化过程中相对保守。蛋白质互作预测结果显示，Bad蛋白与Bcl-2、Akt、Ywhaq、Ywhaz和Ywhab等蛋白相互作用，提示Bad蛋白与这些蛋白间的相互作用可能促进麝鼠香腺萎缩；与Mapk8等互作提示在香腺发育时具有抑制凋亡的作用。研究结果为进一步探究麝鼠Bad基因在香腺周期性发育中的功能提供参考。

关键词

麝鼠 / Bad基因 / 生物信息学分析