高海拔地区地形起伏大、紫外线较强、气候干燥、气温变化大、气压低、氧气含量少,这种极端恶劣的地理环境对人体生活和生存造成巨大的威胁。而高原地区特殊的地形优势形成了大量的山脉、湖泊和独特的地域环境,吸引了众多游客前来驻足感受高原环境的魅力。当人们第一次进入高原地区时,低压低氧环境会引起身体出现一系列不适症状,如头痛、头晕、胸闷、气短、呕吐、腹泻等,这些症状被称为高原反应
[1]。这种特殊地理环境对临时进驻者和当地居民是一个巨大的压力和挑战,持续低氧刺激导致缺氧诱导因子(hypoxia inducible factors,HIFs)和活性氧(reactive oxygen species,ROS)产生增加
[2-3],使机体各器官系统受到不同程度影响,导致高原肺水肿(high-altitude pulmonary edema,HAPE)、高原脑水肿(high-altitude cerebral edema,HACE)、急性高山病(acute mountain sick,AMS)等高原病的发生
[4]。
脾脏是机体最大的外周免疫器官,对机体的免疫调节起着重要的作用,通过免疫调节和免疫监视等功能帮助机体抵御各种细菌和病毒的感染。在某些情况下,脾脏还可以分泌抗炎因子、释放抗原抗体复合物,帮助控制炎症反应,减轻疾病症状,是机体抵御外界感染的重要防线。外界环境的急剧变化导致脾脏微环境及其功能受到影响,从而引发炎症反应、免疫失衡等问题
[5]。
泛素化修饰,作为一种重要的蛋白质翻译后修饰(protein post-translational modification,PTMs)机制,利用共价修饰的方法,将特定的小分子官能团引入到蛋白质的氨基酸侧链中,调控其活性、结构、定位及相互作用,进而实现对其生物功能的动态变化进行精细调控。泛素化修饰作为真核细胞内主要的蛋白质翻译后修饰之一,介导细胞内蛋白质的特异性降解
[6],广泛参与并调控细胞内基因转录、信号转导、DNA损伤与修复、细胞周期调控、应激反应甚至个体的免疫应答等几乎所有的生命活动过程
[7-8]。近年来,基于蛋白质泛素化富集及质谱分析的快速发展,利用质谱技术以确定来自蛋白质的泛素化位点,使泛素化蛋白质组学研究取得了重大进展。因此,本研究利用泛素化修饰组学分析低氧暴露对小鼠脾脏组织中蛋白的变化,探究高原低氧条件下炎症相关通路的作用机制。
1 材料和方法
1.1 材料
1.1.1 实验动物及分组
本研究以6~8周龄的SPF级C57BL/6雄性健康小鼠(购自西安交通大学医学部实验动物中心,动物许可证号:SYXK2020-005)为研究对象,将小鼠随机分为2组(每组5只),其中1组饲养于海拔400 m的西安交通大学医学部实验动物中心,作为本次实验的对照组即平原常氧组(plain spleen control,PSC);另1组饲养于海拔4 200 m的青海省果洛藏族自治州玛多县人民医院实验动物房,作为实验组即高原低氧组(high-altitude spleen test,HST)。在此期间,始终保持2组间温度、湿度及饮水、进食一致的饲养条件。造模30 d后,无菌采集小鼠脾脏组织,一部分保存于液氮中备用,另一部分置于4%多聚甲醛中固定保存。
1.1.2 实验试剂与仪器
4%多聚甲醛(Servicebio公司,武汉);苏木精-伊红染色法(hematoxylin and eosin staining,HE)染色试剂盒(Solarbio公司,北京);中性树胶(Solarbio公司,北京);动物全蛋白提取试剂盒(Sangon Biotech公司,上海);BCA蛋白浓度测定试剂盒(Beyotime Biotech公司,上海);SDS-PAGE凝胶制备试剂盒(Solarbio公司,北京);硝酸纤维素(NC)膜(Pall Corporation公司,美国);鼠源HIF-1α(货号:66730-1-Ig)蛋白抗体、鼠源PLA2G4A(货号:68133-1-IG)蛋白抗体、鼠源PLCG2(67011-1-IG)蛋白抗体、辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔二抗、辣根过氧化物酶标记的山羊抗鼠二抗均购自Proteintech公司;兔源PDGFRRA(货号:AF0241)蛋白抗体(Affinity公司);增强化学发光液(Thermo Fisher Scientific公司,美国)。电泳仪、转膜仪(Bio-Rad公司,美国);生物显微镜(来宝公司,济南);凝胶成像系统(VILBER公司,法国)。
1.2 方法
1.2.1 小鼠脾脏组织病理学检查
用4%多聚甲醛固定小鼠脾脏组织,乙醇脱水处理,随后将脾脏组织用石蜡包埋、切片、二甲苯脱蜡,使用HE染色,最后显微镜下观察组织切片。
1.2.2 泛素化修饰组学
①蛋白质提取:从-80 ℃冰箱中取出组织进行低温研磨至粉末,采用尿素(8 M尿素,100 mM Tris/HCl,pH 8.5)缓冲液,用于样品裂解和蛋白提取。用Bradford蛋白检测试剂盒定量测定蛋白的量,并用裂解液将体积调整一致。② 肽段酶解:加入DB蛋白溶解液将蛋白样品补足体积至100 μL,加入胰酶和100 mmol/L TEAB缓冲液,37 ℃酶切4 h后,加胰酶和CaCl2酶切过夜。然后加100 μL TEAB缓冲液和41 μL乙腈溶解的TMT标记试剂复溶,室温下颠倒混匀反应2 h。最后加入终浓度8%氨水终止反应,取等体积标记后的样品混合,除盐后冻干。③泛素化肽段富集:样品在1.4 mL预冷IAP缓冲液中重组,加入预处理的anti-K-ɛ-GG抗体珠PTMScan泛素残留基序(anti-K-ɛ-GG)试剂盒,细胞信号技术,4 ℃孵育1.5 h,2 000×g离心30 s,弃上清液。anti-K-ɛ-GG抗体珠用1 mL预冷的IAP缓冲液洗涤3次,然后用预冷水洗涤3次。加入40 μL 0.15% TFA,室温孵育10 min,再加入0.15%TFA,2 000×g离心30 s,用C18级Tips脱盐。④液质联用(LC-MS)技术检测:取20 μL互作蛋白,加入1×SDSPAGE Sample Loading Buffer进行SDS-PAGE。待蛋白电泳至分离胶约5 cm时,将目的胶条切下移至1.5 mL离心管,-20 ℃保存。⑤生物信息学分析:采用MaxQuant软件对质谱分析原始数据进行查库鉴定及定量分析,并对定量信息进行归一化处理;利用Blast2GO对目标蛋白质集合进行GO注释;利用KEGG自动注释服务器(KEGG automatic annotation server,KAAS)软件对目标蛋白质集合进行KEGG通路注释,从蛋白质协调作用的角度阐述变化规律。
1.2.3 实时荧光定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)和蛋白免疫印迹(Western blot)
将RNA逆转录为cDNA。以β-actin作为内参,采用2
-ΔΔCt法计算基因的mRNA相对表达量,各引物序列详见
表1。反应体系包括TB Green
® Premix Ex Taq™ Ⅱ 10 μL,ddH
2O 6.4 μL,cDNA 2 μL,前后引物各0.8 μL。经过45个循环扩增,检测HIF-1α、白细胞介素(interleukin,IL)-1β、IL-6、IL-12、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)的mRNA表达量。
提取小鼠脾脏组织蛋白,采用BCA法对所提取蛋白进行浓度测定,调整上样浓度至30 μg/孔,然后经十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳将蛋白质分离,加样后进行电泳(恒压90 V)和转膜(横流200 mA)。将TBST洗液清洗后的NC膜在室温下用无蛋白快速封闭液封闭10 min。加入一抗HIF-1α(1∶2 000)、PLA2G4A(1∶1 000)、PLCG2(1∶5 000)、PDGFRA(1∶500)、β-actin(1∶10 000),4 ℃孵育过夜。TBST洗液洗膜(5 min/次,6次+10 min/次,1次)后,加入羊抗兔二抗(1∶1 000),羊抗鼠二抗(1∶5 000),室温孵育1 h。再次洗膜(6 min/次,5次)后,用ECL化学发光液进行显色,凝胶成像系统观察分析。
1.3 统计学方法
使用SPSS 18.0软件进行数据分析,符合正态分布的计量资料采用均数±标准差()表示。2组间比较采用两独立样本t检验。检验水准α=0.05。
2 结果
2.1 小鼠脾脏组织HIF-1α的表达与病理学检测
为了验证高原低氧小鼠建模是否成功,检测HIF-1α的mRNA与蛋白表达量,结果显示,低氧诱导小鼠脾脏组织的HIF-1α表达量明显上调(
图1A~C)。在组织学分析HE染色结果显示,HST组小鼠脾脏组织白髓减少,生发中心范围扩大,分界模糊,并伴有静脉充血;此外,可见部分细胞凋亡、核固缩、核碎裂等(
图1D)。提示,高原低氧环境下小鼠脾脏组织发生炎症性病理学改变。
2.2 泛素化修饰组学质量评估
为了评估数据可靠性,使用Andromeda分析工具对质谱图谱数据进行分析,获得质谱图谱的得分。所有鉴定泛素化肽段的质量偏差均在10 ppm以内(
图2A),说明鉴定结果准确可靠;泛素化肽段离子质量偏差分布结果显示67.06%的修饰肽段得分在60分以上,肽段得分中位数为:74.85分(
图2B)。以肽段错误发现率和蛋白质错误发现率结合质量偏差作为筛选标准,结合肽段得分分布,表明质谱数据质量较高,可用于后续分析。
2.3 修饰肽段鉴定数量与差异分析
共鉴定到的泛素化蛋白质、泛素化肽段、泛素化位点的数目分别为1 457、2 982、3 373,其中1 100个修饰蛋白上有2 089条可定量泛素化肽段,2 255个可定量泛素化位点(
图3A)。为了分析组内样本之间泛素化修饰鉴定的重复性,采用韦恩图分析组内样本重复情况。HST组和PSC组内所有生物学重复鉴定到的泛素化肽段集合的重叠情况(
图3B)。在明显性差异修饰肽段筛选中,以表达倍数(Fold Change,FC)>2.0倍(上调大于2.0倍或下调小于0.5倍)且
P<0.05为标准,共鉴定出69个差异表达泛素化肽段,其中46个修饰肽段表达上调,23个修饰肽段表达下调(
图3C)。以FC>2.0倍且
P<0.05的筛选标准得到的显著差异表达泛素化肽段对应的蛋白质可以有效地把比较组分开,说明差异表达泛素化肽段筛选能够代表生物学处理对样本影响(
图3D)。其中红色代表明显性上调的肽段,蓝色代表明显性下调的肽段,灰色部分代表无肽段定量信息。
2.4 泛素化肽段功能分析
通过统计修饰肽段上泛素化修饰位点的上下游各6个氨基酸出现次数,从而找到氨基酸出现频率分布规律,获得具有保守性的氨基酸基序,鉴定到泛素化肽段的前6 位 motif序列形式如
图4A所示,所有鉴定到泛素化修饰肽段在不同保守 motif 中的数量分布(
图4B),结果表明赖氨酸(K)、精氨酸(R)及其motif序列在泛素化肽段中明显分布;亚细胞定位分析表明修饰蛋白主要分布在细胞核、细胞质、线粒体、质膜等亚细胞结构(
图4C),有助于进一步探究蛋白质在细胞中发挥的具体功能。
2.5 差异表达泛素化肽段对应蛋白质的GO注释分析和KEGG通路富集分析
为了进一步了解差异表达泛素化肽段在高原低氧胁迫下的生物学功能和富集通路,对差异表达泛素化肽段对应的蛋白质进行GO功能注释分析发现其主要富集在应激、细胞增殖、分化等生物过程(
图5A),KEGG通路富集分析结果显示,差异表达泛素化肽段对应的蛋白质显著富集在MAPK信号通路、Ras信号通路、PI3K-AKT信号通路等信号转导通路以及中性粒细胞胞外陷阱形成(NET)、趋化因子信号通路等免疫系统相关通路中(
图5B)。
2.6 关键蛋白及炎症相关基因定量分析
通过Western blot检测明显富集的MAPK信号通路、RAS信号通路和NET信号通路中关键蛋白的表达量,结果表明,HST组PLCG2泛素化修饰水平明显升高(
P=0.004)(
图6A),蛋白表达水平呈现下调趋势(
P=0.022)(
图6B、D),与PSC组相比,PDGFRA(
P=0.045)和PLA2G4A(
P=0.015)蛋白表达量上调(
图6C、E)。以上结果表明低氧暴露导致小鼠脾脏组织蛋白表达水平发生显著变化。随后通过RT-qPCR技术检测了炎症因子IL-1β、IL-6、IL-12和TNF-α的mRNA表达量。结果显示,炎症因子IL-1β(
P=0.009),IL-6(
P<0.001),IL-12(
P=0.014),TNF-α(
P<0.001)表达量均显著上调(
图6F),进一步表明,低氧暴露诱导小鼠脾脏组织发生炎症反应。
3 讨论
高原低氧刺激会导致细胞内多种物质发生一系列变化,其中包括炎性因子、氧自由基和氧合血红蛋白的增加。研究表明,HIF-1α是维持氧稳态的关键调节因子
[9],在调节细胞代谢、信号转导和转录活化等过程中发挥重要作用。低氧刺激使HIF-1α高表达,通过调节多种信号通路和下游基因来介导内源性适应性程序,使机体产生一系列适应性改变,包括免疫功能改变、抗感染能力下降、凝血功能异常等
[10]。此外,HIF-1α参与免疫反应和炎症反应的调节
[11-12]。本研究将小鼠低氧暴露30 d后,发现与PSC组相比,HE染色结果显示HST组小鼠脾脏组织白髓减少,生发中心范围扩大,HST组小鼠脾脏组织HIF-1α表达量明显升高,表明低氧刺激导致小鼠脾脏组织结构破坏,使机体免疫功能和炎症反应受到重要影响。因此,本实验通过泛素化修饰组学进一步分析,旨在深入了解高原低氧条件下小鼠脾脏组织变化的分子机制。
本研究采用泛素化修饰组学技术分析小鼠脾脏组织蛋白,发现高原低氧条件下共鉴定出69个差异表达泛素化肽段,并且这些差异表达泛素化肽段明显富集在MAPK信号通路、Ras信号通路和NET形成通路中。据报道,MAPK信号通路在炎症、细胞增殖、凋亡、免疫反应以及细胞周期调控中发挥重要作用
[13-14]。MAPK信号通路由Ras-Raf-MEK-ERK信号级联组成,协同调控细胞的生长、分化、应激和炎症反应等一系列重要的细胞生理与病理过程
[15]。由于ERK级联的重要性,ERK紊乱对细胞有害,并最终对机体造成损伤。ERK通路中上游蛋白和激酶的过度激活与癌症、炎症、发育障碍和神经系统疾病等密切相关
[16]。在ERK通路中,Ras充当上游激活蛋白,Ras信号通路调控着人体众多的生理机能,与心血管疾病、类风湿关节炎等疾病的发生发展有关
[17]。NET形成与补体激活、膜攻击复合物以及自身免疫性疾病有关,并且NETs通过上调巨噬细胞IL-1β的产生和间接激活Th17细胞促进炎症反应发生
[18]。提示高原低氧环境刺激导致脾脏组织发生明显泛素化富集的MAPK、Ras和NET形成3条通路均与免疫炎症相关。为了进一步探究低氧胁迫导致MAPK、Ras和NET形成通路发生泛素化异常的分子机制,选取通路中关键蛋白PLCG2及其上下游蛋白PDGFRA和PLA2G4A进行蛋白表达量检测。
PDGFRA编码受体酪氨酸激酶蛋白家族的成员,与相应配体结合触发PDGFRA二聚化和自磷酸化,激活下游信号通路,即RAS/MAPK/ERK通路、PI3K/AKT通路、JAK/STAT通路和PLC-PKC
[19],导致癌细胞增殖、存活和侵袭。PDGFRA通过与其同源配体结合来发挥其酪氨酸激酶活性,在与其相应的配体PDGF(s)结合时被激活,并调节细胞分裂和增殖
[20]。研究表明,PDGFRA是一种经典的原癌基因,在神经胶质瘤中高度表达、扩增、突变,可以调节神经胶质瘤的进展
[21],并且是胶质母细胞瘤的一个预后标志物和潜在治疗靶点
[22]。本次研究结果显示,低氧胁迫导致PDGFRA蛋白表达水平上调,提示PDGFRA对下游的PLCG2、RasGRPs等蛋白的激活作用增强,并促进Ras信号通路的作用。
PLCG2是一种跨膜信号转导酶,参与免疫反应调节的信号通路,能够识别细胞膜上的配体,可催化磷脂PIP2(1-磷脂酰基-1D-肌醇-4,5-二磷酸)转化为1D-肌醇-1,4,5-三磷酸和二酰基甘油,在细胞表面受体信号转导中起关键作用。PLCG2催化的IP3和随后的钙信号可确保B淋巴细胞具有正确的发育结果和抗原特异性反应
[23]。研究发现,PLCG2是一种重要的B细胞调节因子,在BCR信号转导时,B细胞受体刺激PLCG2与B细胞接头蛋白相互作用
[24],CD19是BCR/PLCG2信号转导复合体的重要组成部分,其在B细胞介导的自身免疫性和炎症性疾病中起着关键作用
[25]。此外,PLCG2对NK细胞对恶性和病毒感染细胞的反应至关重要,还参与许多癌症的增殖和迁移
[26]。已有研究表明,PLCG2参与肿瘤微环境重塑,并被确定为软组织肉瘤和结肠癌的免疫相关基因
[27]。Chan JM等
[28]发现小细胞肺癌(small-cell lung cancer,SCLC)中PLCG2的表达与总生存期呈负相关,PLCG2高表达的肿瘤患者的总体生存期较差,并且在SCLC肿瘤中鉴定出一个促纤维化、免疫抑制性的单核细胞/巨噬细胞群,该群体与复发性PLCG2高表达亚群特别相关。PLCG2功能障碍与免疫缺陷病、自身免疫、癌症和神经退行性疾病等一系列疾病有关
[29-30],研究发现,PLCG2缺陷小鼠虽然具有正常数量的肥大细胞,但FcεRI刺激的钙通量、1D-肌醇-1,4,5-三磷酸生成、脱颗粒和细胞因子反应受损,靶向PLCG2有助于治疗过敏反应相关疾病
[31]。此外,PLCG2对早期B细胞发育至关重要,PLCG2缺失可造成B细胞发育和功能的障碍,引起血清免疫球蛋白水平降低,导致机体适应性免疫功能异常
[25],并且PLCG2的异常表达会导致自身炎症性疾病的发生
[32]。本研究发现低氧暴露下PLCG2泛素化修饰水平明显上调,蛋白表达水平下调,提示高原低氧环境通过泛素化修饰明显降低了PLCG2的表达,影响免疫细胞活化、增殖和分化等过程,导致机体免疫系统功能障碍和炎症性疾病。
PLCG2经过Ras-Raf-MEK-ERK途径最终激活PLA2G4A,PLA2G4A水解膜磷脂,从而释放多不饱和脂肪酸花生四烯酸,进一步代谢为白三烯、血栓素和前列腺素,在调节炎症反应、膜和肌动蛋白动力学以及肿瘤发生等多种生物过程中发挥重要作用,其表达由促炎细胞因子和脂多糖诱导
[33]。PLA2G4A是脂质代谢重编程的关键调节因子,研究表明,聚合酶1和转录释放因子触发细胞质磷脂酶A2介导的磷脂重塑途径,促进胶质母细胞瘤肿瘤细胞增殖并抑制肿瘤免疫反应
[34]。而磷脂酶A2/环氧合酶途径紊乱表明花生四烯酸水解和代谢的激活,导致膜脂质稳态和免疫功能异常,进一步增加了精神分裂症的风险
[35]。有研究发现,PLA2G4A的表达和活性使神经元细胞对自噬敏感,并在缺血再灌注诱导的ROS生成后,促进线粒体脂质过氧化及铁死亡
[36]。Sarkar C等
[37]发现,在神经退行性疾病、创伤性脑损伤和缺血性中风中,PLA2G4A的活性和表达水平均增加,并与神经元细胞死亡有关,使其成为治疗干预的一个有吸引力的靶点。本研究发现,高原低氧条件下,小鼠脾脏组织中PLA2G4A蛋白表达水平上调,提示高原低氧条件下免疫系统紊乱和炎症反应发生。因此,本研究进一步检测了炎症因子表达水平,发现低氧诱导炎症因子IL-1β、IL-6、IL-12和TNF-α的mRNA表达量显著上调,提示低氧暴露下小鼠脾脏组织出现炎症反应。
综上所述,本研究通过泛素化修饰组学研究高低海拔暴露下的小鼠脾脏组织,发现差异表达泛素化肽段对应的蛋白质显著富集在MAPK信号通路和Ras信号通路和NET信号通路中,提示低氧胁迫导致信号转导通路和免疫系统相关通路发生重要变化,进一步对通路中关键蛋白进行定量验证,结果提示高原低氧环境通过泛素化修饰改变PLCG2及其上下游蛋白(PDGFRA和PLA2G4A)的蛋白表达量,影响免疫细胞活化、增殖和分化等过程,从而介导机体免疫炎症性疾病的发生;通过对炎症因子表达量的验证,同样提示低氧暴露导致脾脏组织炎症反应发生。本研究为深入探讨高海拔缺氧对脾脏组织免疫功能的影响及炎性反应的形成机理提供新的思路。
利益冲突 所有作者声明不存在利益冲突