循环外泌体源性微RNA用于胃癌早期诊断的筛选和鉴定

摘要

目的：通过筛查外周血中肿瘤特异性来源的外泌体中的微RNA，建立一种新的胃癌早期诊断方法。方法：从基因表达综合数据库中下载胃癌外泌体数据集GSE148334和GSE130654，以logFC>1或logFC<-1,P<0.05为标准筛选差异RNAs；通过TargetScan和ENCORI数据库预测mRNA-miRNA-lncRNA之间的调控关系，用Cytoscape软件绘制ceRNA网络并筛选Hub基因进行验证。纳入27例早期胃癌患者、25例健康对照和25例其他癌症患者为研究对象，通过超速离心法分离血清外泌体。提取血清和外泌体样本中的RNA进行实时荧光定量聚合酶链式反应（real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR）试验，分析Hub基因在各组的表达情况。结果：通过生物信息学方法筛选出3个Hub基因hsa-miR-105-5p、hsa-miR-219b-3p和hsa-miR-889-3p,RT-qPCR结果显示hsa-miR-219b-3p在胃癌组血清和外泌体样本中的表达均明显高于健康对照组和其他癌组（血清：4.050±2.697,1.357±0.857,1.934±2.434；外泌体：2.525±1.518,0.774±0.559,1.259±2.127），差异有统计学意义（P<0.05），而hsa-miR-105-5p和hsa-miR-889-3p在胃癌组和其他两组之间表达差异无统计学意义（P>0.05）。外泌体hsamiR-219b-3p的受试者工作特征曲线下面积为0.896(95%CI=0.800～0.993)，明显优于传统肿瘤标志物癌胚抗原（P=0.015）、糖类抗原19-9(P=0.021)和糖类抗原72-4(P=0.005)，所以外泌体hsa-miR-219b-3p在胃癌患者中具有更优的诊断效能。结论：血清外泌体来源的hsa-miR-219b-3p有作为早期胃癌诊断标志物的潜力。

关键词

胃癌 / 外泌体 / 生物信息学 / 微RNA / hsa-miR-219b-3p