卵巢癌乳酸化修饰亚型的鉴定及预后评分模型构建与免疫疗效预测

摘要

目的 在卵巢癌中鉴定与乳酸化修饰相关的分子分型，构建预后评分模型，并预测免疫治疗效果。方法基于癌症基因组图谱-卵巢癌（TCGA-OV）数据集及基因表达综合数据库（GEO）的GSE63885、GSE26193数据集，对乳酸化修饰相关基因进行预后和生存分析。采用无监督聚类方法将卵巢癌患者分为4种乳酸化修饰分型（LRGCluster），并对其差异基因进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过单因素Cox回归分析（P <0.000 1），筛选出预后相关基因（PRGs），并通过实时荧光定量聚合酶链反应（RT-qPCR）验证其在正常卵巢组织、早期及晚期卵巢癌组织中的表达情况。基于这些基因，进一步通过二次无监督聚类将患者分为2种基因分型（geneCluster），并构建预后评分系统LactyScore。同时，依据LactyScore分层，对样本进行免疫细胞浸润分析、免疫治疗预测及药物敏感性分析。结果 鉴定出4种LRGCluster和2种geneCluster，并筛选出5个与卵巢癌预后密切相关的差异表达基因：胶原蛋白ⅩⅥ型α1链（COL16A1）、家族转录抑制因子SPEN、含AT钩DNA结合基序1(AHDC1)、亮氨酸拉链蛋白1(LUZP1)和基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)。RT-qPCR结果显示，SPEN、COL16A1、AHDC1、LUZP1可能为预后的危险因素，而SDF2L1可能为预后的保护因素。基于这5个基因构建的LactyScore预后评分系统显示，高LactyScore组患者的生存率高于低LactyScore组。高LactyScore组患者具有较高的免疫逃逸潜力和较低的免疫治疗应答率。结论 COL16A1、SPEN、AHDC1、LUZP1和SDF2L1为与卵巢癌预后密切相关的乳酸化修饰基因亚型，这些基因具有作为卵巢癌生物标志物的潜力。基于这5个基因构建的LactyScore预后评分系统可有效预测卵巢癌患者的预后，并为不同患者分层提供免疫治疗效果预测依据。

关键词

卵巢癌 / 乳酸化修饰 / 预后评分模型 / 免疫治疗

基金资助

国家自然科学基金（82272850）; 广东省自然科学基金（2024A1515010596）; 国家卫生健康委医药卫生科技发展研究中心基金（WKZX2023CX130001）