无底物情况下来自Rhodococcus zopfii的腈水解酶中亲核进攻试剂CYS165的活性状态的探究（英文）

摘要

腈水解酶作为一类在工业应用中具有巨大价值的绿色生物催化剂，能够高效地催化腈基化合物转化为羧酸.尽管其应用广泛，但腈水解酶的具体催化机制仍然不明确.先前的研究揭示了腈水解酶活性中心的GLU-LYS-GLU-CYS四联体在催化中起到关键作用，其中CYS残基作为亲核试剂攻击腈基，其硫醇基团的电离是反应中的一个关键步骤，然而，CYS的去质子化过程尚未被清晰揭示.研究聚焦于来自Rhodococcus zopfii (RzNIT)的腈水解酶，并研究了底物尚未进入酶活性位点时CYS165的质子化状态.通过对CYS165去质子化可能路径的详细分析，确认了在无底物状态下RzNIT中的CYS165处于中性状态.这一发现为进一步研究RzNIT的催化机制奠定了基础.

关键词

ONIOM (the Own n-Layered Integrated Molecular Orbital and Molecular Mechanics) / 腈水解酶 / 能垒 / 催化机制