基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型

孙希野, 蒋灿, 罗旭, 舒佩, 王森, 周科讯, 黄媚娟

四川大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 61 ›› Issue (03) : 341 -351.

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四川大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 61 ›› Issue (03) : 341 -351. DOI: 10.19907/j.0490-6756.2024.036005

基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型

    孙希野, 蒋灿, 罗旭, 舒佩, 王森, 周科讯, 黄媚娟
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摘要

为了解并评估食管癌患者的预后,提前预测其疾病进展和生存情况.本研究在基因表达综合数据库(GEO)中收集食管癌相关基因和临床数据,筛选与预后相关的细胞焦亡和铁死亡基因,并利用随机森林算法开发构建食管癌预后风险模型,最终在癌症基因组图谱(TCGA)-ESCA队列中进行验证,同时分析不同风险组肿瘤微环境中免疫细胞的浸润情况.结果显示训练队列中低风险组的生存明显优于高风险组(P<0.05).训练队列中低风险组与高风险组患者相比有更多CD4+T细胞,低风险组中CD8A、GZMB、PRF1的表达水平高于高风险组(P<0.05).以上结果表明基于焦亡和铁死亡基因组学所构建的ESCA预后模型可为食管癌患者的临床治疗提供参考.

关键词

食管癌 / 焦亡 / 铁死亡 / 预后风险模型 / 公共数据库

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基于焦亡和铁死亡基因构建食管癌预后模型[J]. 四川大学学报(自然科学版), 2024, 61(03): 341-351 DOI:10.19907/j.0490-6756.2024.036005

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