四川、北京两地圈养大熊猫免疫差异研究

摘要

为揭示地域因素对大熊猫免疫功能的影响，本研究对四川和北京圈养大熊猫外周血单核细胞（peripheral blood mononuclear cell;PBMCs）对脂多糖（LPS）免疫应答的差异进行比较.采集了在四川长期生活以及北京长期生活的圈养大熊猫血液样本并分离PBMCs，在LPS刺激后进行了转录组测序并分析差异基因表达谱.四川和北京圈养大熊猫PBMCs在LPS刺激后，共检测到5157个差异基因，其中2954个基因上调，2203个基因下调.进一步的基因本体（GO）富集和KEGG通路分析显示，北京圈养大熊猫中上调的基因主要富集于免疫系统进程、免疫反应、对压力的反应及天然免疫反应等，并显著富集于Toll样受体信号通路、NF-kappa B信号通路及Th17细胞分化等KEGG通路，表明北京大熊猫在LPS刺激下具有更强的免疫应答潜能.此外，蛋白质-蛋白质相互作用网络分析揭示了TLR4在北京圈养大熊猫上调基因蛋白网络的枢纽作用.北京圈养大熊猫PBMCs在LPS刺激后，多个与免疫应答密切相关的基因家族（如白细胞介素、趋化因子、干扰素诱导基因及NFKB2等）表达显著上调，而四川大熊猫中仅IL-18和IL2表达较高.

关键词

四川和北京两地圈养大熊猫 / PBMCs / LPS / 免疫应答后 / 差异比较研究