藻菌共生促进小球藻生长的转录组差异分析

张苡芃, 吕岳霞, 曹馨雨, 兰利琼, 卿人韦

四川大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 61 ›› Issue (06) : 222 -229.

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四川大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 61 ›› Issue (06) : 222 -229. DOI: 10.19907/j.0490-6756.2024.066003

藻菌共生促进小球藻生长的转录组差异分析

    张苡芃, 吕岳霞, 曹馨雨, 兰利琼, 卿人韦
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摘要

为探究细菌群落对小球藻生物量促进作用的根源,本文利用RNA-seq技术进行转录组测序并通过生物信息学方法进行数据分析.结果显示,藻菌共生下的小球藻相较纯培养小球藻共有5846个基因发生变化,有3786个基因上调,2060个基因下调. GO富集分析结果显示,差异基因主要被富集到物质运输、膜系统组成、转运活性等相关过程中. KEGG富集分析结果显示,小球藻的碳代谢过程、氮代谢过程、有机物质的运输和植物信号传导等植物生长代谢途径大部分相关基因在藻菌共生培养下均发生上调,叶绿素合成、光合作用和光合作用天线蛋白大部分基因下调.研究结果表明,细菌群落对小球藻生物量的促进作用可能是通过产生信号分子来刺激激素介导的信号转导途径,进而提高小球藻碳、氮代谢相关基因上调,从而促进小球藻细胞的分裂.

关键词

藻菌共生 / 小球藻 / 活性污泥 / 细胞分裂 / 转录组学

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藻菌共生促进小球藻生长的转录组差异分析[J]. 四川大学学报(自然科学版), 2024, 61(06): 222-229 DOI:10.19907/j.0490-6756.2024.066003

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