新型猫过敏原蛋白NPC2的同源建模及抗原表位预测

摘要

近期研究发现，14.5%的猫过敏患者血清中存在针对新型猫过敏原蛋白——尼曼匹克C2型蛋白（Niemann-Pick type C2,NPC2）的高特异性免疫球蛋白E（IgE）。为了深入解析该蛋白的致敏机制，并开发高效、精准的多表位疫苗，本研究针对猫的新型过敏原NPC2进行了疏水性分析、磷酸化位点预测、糖基化位点预测以及信号肽预测分析；通过NCBI数据库的蛋白质序列比对后建立猫过敏原蛋白NPC2的系统进化发育树；使用SOPMA软件对NPC2蛋白进行二级结构的预测分析，利用Swiss-Model进行了3D结构的同源建模，并与犬过敏原蛋白Can f7的抗原表位进行了比较。结果：猫过敏原蛋白NPC2与美洲狮NPC2蛋白的序列同源率最高，达到99.33%;猫过敏原蛋白NPC2的B细胞线性抗原表位序列为⁸⁵FPIPEADGCKSG⁹⁶、²²VIFKDCG²⁸、¹⁰⁰PIQQGKTYSY¹⁰⁹、⁶⁵VSSQG⁶⁹、¹³²GDKEQ¹³⁶和¹¹⁵VKNEYPS¹²¹,T细胞表位为²⁶DCGSGFGVI³⁴、¹²⁹QLLGDKEQN¹³⁷、⁶VAFVLLALSASGLAE²⁰、⁷¹KALVYGILMGVAVPF⁸⁵和¹¹⁶KNEYPSIKVMVKWQL¹³⁰;猫过敏原蛋白NPC2的构象性表位主要位于无规卷曲区域；此外，猫过敏原蛋白NPC2与犬过敏原蛋白Can f7的抗原表位序列具有一定的相似性，可能具有免疫交叉反应性和交叉保护性。综上，本研究通过生物信息分析获得了猫过敏原蛋白NPC2的B细胞、T细胞优势抗原表位，其结果可为宠物过敏原蛋白的多表位疫苗研究提供理论基础，并为对猫过敏的免疫治疗提供新的干预靶点和策略。

关键词

猫过敏原 / 生物信息学 / 抗原表位预测