中国东北地区3种啮齿动物结肠内真菌多样性的比较研究

摘要

旨在了解啮齿动物肠道真菌的多样性以及鼠类疫源疫病的监测、诊断、治疗和防控。本试验通过高通量测序技术联合培养组学，对东北地区6只黑线姬鼠(Myodes rufocanus)、15只大林姬鼠(Apodemus peninsulae)和18只棕背鼠平(Myodes rufocanus)进行物种相对分布、聚类热图、分类丰度的种间差异、物种分类的Kruskal-Wallis和ANOVA分析。结果：这3种啮齿动物肠道内真菌在门水平上排在前5的种类均包含担子菌门(Basidiomycota)、毛霉门(Mucoromycota)、子囊菌门(Ascomycota)以及捕虫菌门(Zoopagomycota),在属水平上排在前5的均包含丛枝菌根真菌(Rhizophagus),在种水平上3种啮齿动物未发现共有的真菌种类；组间差异分析表明，3种啮齿动物肠道真菌在种水平(R=0.827、P=0.001)和属水平(R=0.777、P=0.001)上均有显著差异，与大林姬鼠和棕背鼠平相比，黑线姬鼠肠道内含有多种特有菌种。综上，本研究初步分离并鉴定了3种啮齿动物的肠道真菌，为进一步研究东北地区啮齿动物肠道真菌菌群差异的成因提供依据。

关键词

啮齿动物 / 肠道菌群 / 真菌多样性 / 高通量测序 / 宏基因组